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DNA的粗提与鉴定.ppt

DNA的粗提与鉴定 四个标准 所得DNA的纯度应满足下游操作的要求; 所得DNA应当完整; 所得DNA应有足够的量; 如果是对植物进行大规模的筛选,还应当满足操作程序快速,简单,价格低廉,并尽量避免使用有毒试剂。 一、实验目的 掌握DNA提取技术操作原理 培养分子生物学实验操作能力和观察能力。 二、实验原理 通过去污剂破碎细胞膜,释放出基因组DNA,利用DNA不溶于乙醇的特点从细胞粗提液沉淀出DNA分子。最后通过核酸特异染料二苯胺进行鉴定。 实验材料:新鲜菜花 药品: DNA提取液(1000 ml): 秤取Tris 10.1 g,先加入50 ml蒸馏水溶解,然后用浓HCl调pH至8.0,再加入NaCl 8.76 g,EDTA 37.2 g, SDS 20 g,待药品全部溶解后定容至1000 ml。 二苯胺试剂的配置: 称取1.5克二苯胺,溶于100mL冰醋酸中,再加1.5mL浓硫酸,用棕色瓶保存。临用前,在10mL的上述溶液中再加入0.1mL体积分数为0.2%的乙醛溶液。 药品在DNA提取中的作用 NaCl: 高盐去除糖类,中和DNA侧链的磷酸根离子的负电荷,以减少DNA分子之间的排斥,便于沉淀。 Tris(三羟基氨基甲烷) :和HCl一起构成缓冲对,能维持提取溶液pH 环境。 EDTA(四乙酸乙二胺二钠): 螯合剂,能螯合DNA 酶活性所需的Mg2+,防止DNA被DNA 酶降解。 SDS(十二烷基硫酸钠):去污剂,破坏细胞膜,变性蛋白,抑制DNA 酶活性。 二苯胺:核酸特异染料 四、实验步骤: 取5g菜花顶花部分放入研磨过滤器中,加入 5 ml DNA提取液,充分研磨。 将研磨液转移置10 ml离心管中, 65℃保温10 min。 6000rpm离心10min。 取上清液至另一个10 ml离心管中。 加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),混匀。12000rpm离心10min。小心吸取上清液至另一个10ml离心管中。 加入2倍体积的 100%乙醇,混匀,会看到白色絮状沉淀,可用玻璃棒挑,此为粗提植物基因组DNA。 弃去乙醇,吹干沉淀后溶于1ml灭菌重蒸水中。 二苯胺鉴定:在上述DNA溶液中加入1ml二苯胺试剂,混匀。在另一只管中加1ml灭菌重蒸水和1ml二苯胺试剂,混匀,作为不含DNA对照。将两管在沸水浴中煮10 min,在加热过程中随时观察溶液颜色变化。 移液器的使用说明 使用方法:   使用时将移液器刻度调整到需要量取的数值上,安上相配套的吸头;将取液按钮按到一档后(感觉有明显阻力)将吸头插入需量取的液体中,缓缓松开按钮,液体即被吸入吸头内;缓缓将按钮按到一档将吸头内液体排入所需容器,2-3秒后将按钮按到二档后(不可以再往下按)将残留液体排出即完成取液,使用后使用褪管按钮将吸头放到废物杯中。 注意事项: 使用时不可猛吸猛排,以防溶液进入管腔内,影响密闭并造成污染。 管内吸有液体时禁止将移液器平放,以防液体进入管腔内。 刻度调节不可超过刻度范围,以防卡死。 二苯胺鉴定DNA 用琼脂糖凝胶电泳(0.8%)检测核DNA的完整性 紫外分光光度计检测DNA的浓度和纯度 用紫外分光光度计在230nm、260nm、 280nm和310nm波长分别读数。其中260nm读数用来估计样品中DNA的浓度,OD260/OD280与OD260/OD230的值用于估计DNA的纯度,310nm为背景吸收值。1个OD260值相当于50μg/mL双链DNA。 样品浓度(μg/mL)=(OD260- OD310)×稀释倍数×50 对于DNA纯制品,其OD260/OD280≈ 1.8,OD260/OD230应大于2。OD260/OD280 1.8 说明有RNA污染;OD260/OD2801.8说明有蛋白污染。 * * 微量可调移液器是一种在一定范围内可连续调节的移液器,主要用于少量液体的定量量取。

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