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·40· 生物技术 中国畜牧兽医 2012年第39卷第7期
cDNA文库构建方法的研究进展
刘太峰1’3,孟庆峰4,段小波2。董浩1
(1.吉林农业大学生命科学学院,吉林长春130118;2.吉林农业大学动物科学技术学院,吉林长春130118;
3.吉林农业工程职业技术学院,吉林四平136001t4.吉林出入境检验检疫局。吉林长春130062)
摘要:eDNA文库的构建是一种重要的基因克隆的手段,主要用于新基因的发现及基因功能的研究。作者主要介绍cD-
NA文库的构建方法及eDNA文库的一些实际应用,为研究cDNA文库的构建提供一些有价值参考意见。
关键词:eDNA文库;构建;研究进展
中图分类号:Q78 文献标识码:A 文章编号:1871—7236(2012)07—0040—03
eDNA文库是以特定的组织或细胞mRNA为
mRNA为模板,反转录成eDNA第一链,通过自身
模板,逆转录形成的互补DNA与适当的载体(常用
噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌形成重组 等,2003)。用过柱子或其他方法去除小分子ds
DNA克隆群,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA,对留下来较大的dseDNA切平端,接上接
cDNA克隆集合称为该组织或细胞的cDNA文库
头,磷酸化后克隆到载体中,在细菌中大量繁殖,这
(萨姆布鲁克等,2002)。从20世纪70年代开始,由样每个克隆中都保存有一段该细胞的eDNA。但是
于限制性内切酶的发现及质粒等载体的应用推动了 经典eDNA文库中低丰度表达的序列出现的几率
DNA体外重组技术的发展,eDNA文库的构建是基很低,需要的mRNA量也很大,同时筛选eDNA文
因克隆的重要方法之一,从cDNA文库中能够筛选库的工作量也很大,程序很繁琐。随着分子生物学
到所需要的目的基因,并直接用于该目的基因的表 的快速发展,cDNA文库的构建方法有了很大的进
达,是发现新基因和研究基因功能的基础工具 步(Mahon等。2001)。
(Kkuehi等,2003)。第一个cDNA文库由Hofstet—2差示cDNA文库
ter于1976年构建的,由于刚开始构建的eDNA文差示cDNA文库是反映不同组织和细胞或同
库存在着合成效率低。难以扩增等缺点,许多科研工 一细胞在不同功能状态下,基因表达出现差异的
作者经过不断的努力将文库的构建方法进一步完善
和高效(Seki等,2002)。目前cDNA文库的种类主胞,也可以是同一细胞不同状态的mRNA,将一种
要包括经典eDNA文库、标准eDNA文库、差示
eDNA文库、酵母双杂交文库、mRNA差异显示文
细胞过量的mRNA进行杂交,若第一种细胞中存
库、限制性cDNA文库等(李海红等,2003)。eDNA在不同于第二种细胞的特殊基因,那么第一种细胞
文库构建的一般程序是组织或细胞总RNA的提 的eDNA不能与第二种细胞的eDNA形成杂合双
取,mRNA的富集,cDNA第一链的合成,eDNA第链,分离未形成杂交体的eDNA,以此为模板合成
二链的合成和纯化,接头或连接子与cDNA的链
接,转人受体菌,eDNA文库的克隆及鉴定(朱利军就是差示eDNA文库(Suzuki等,2001)。
3 mRNA差异显示文库
等,2009)。作者主要介绍cDNA文库构建的几种
主要方法及其常规的应用。 mRNA差异显示文库是根据mRNA差异显示
l 经典cDNA文库 技术构建的eDNA文库。其构建程序是用细胞的
A+ 总RNA或mRNA为模板,合成上、下游引物。5’
经典cDNA文库是以细胞或组织的poly
端引物含有Hindm内切酶位点,引物由13个碱基
收稿日期:2
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