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DNA顺序测定中缺失子大小的快速鉴定.pdf

遗传 HEREDITAS(Beijing)11(4):36-3旦鱼夕丝 DNA顺序测定中缺失子大小的快速鉴定 高家国 汪训明 (复旦大学遗传学研究所,上海) 本文介绍了一种DNA顺序测定中缺失子大小的快速鉴定的方法。基本步骤是:用细胞裂解液裂 解被 M13缺失子感染的细胞,离心取.上清直接电泳鉴定缺失子的 RFDNA 的相对大小,从而推侧缺 失的大小。 关锐词:’DNA顺序,缺失子,快速鉴定 DNA顺序测定技术在分子遗传学中占有 (二)缺失子大小的鉴定 用牙签挑取 重要的地位,近十年来得到不断发展和完善。 以方法 一()得到的转化噬菌斑置于2mlLB培 目前,DNA顺序分析法主要是 Maxam和 养液中,加人20川培养过夜的大肠 杆菌 Gilbert13,的化学断裂法及 Sanger[”的双脱氧 JM101,37℃振荡培养过夜。培养液用台式高 链终止法。由于Messingt4l的单链噬菌体载体 速离心机 型(号:TGL-16G,上海医用分析仪 的建立,使双脱氧链终止法简便易掌握,越来越 器厂)15,000rpm离心15分钟,上清40C保存, 受到青睐。 离下的菌体用50川细胞裂解液 1(%0oSDS20.05M 由于电泳系统分辨率的限制,目前一次顺 Tris-HCl,pH6.8,0.002MEDTA,0.4,M蔗糖, 序分析反应只能测定300个左右核营酸对,因 0.1务嗅酚蓝)37℃裂解 15分钟后,,立即用台 此要测定大片段 DNA分子的顺序,先要做亚 式高速离心机离心15分钟,吸取上清液于 克隆分段测定,利用顺序的重叠得出整个DNA 17cm长、0.7务无EB的琼脂糖凝胶上以2V/ 的顺序。 Hong[.,建立的M13载体的非随机 cm电泳 18小时,0.5z1g/mlEB液中染色45 DNA系统测定法,是以靠近引物处为定点,在 分钟,在紫外灯下拍照记录结果。 插人片段内定向产生大大小小的缺失,然后选 (三)缺失子的顺序分析 根据方法 二() 择一系列缺失子 (缺失从小到大)来测定整个插 的电泳结果,从保存的上清液中提取单链 人片段的DNA顺序。由于缺失的大小是随机 DNA,按 Sangerts1双脱氧法进行 DNA顺序 的,缺失子大小的快速鉴定方法的建立,将会为 分析。 寻找系列缺失子提供方便,从而大大地提高顺 结 果 与 讨 论 序测定的效率。本文总结了我们几年来的工作 经验,介绍一种DNA顺序测定中缺失子大小 图1示16个随机克隆的快速鉴定。缺矢 的快速鉴定法。 子 a(-p)的迁移率随机分布在重组克隆 q() 和载体 M(13mp8)(r)之间,表明缺失的大小 材 料 与 方 法 一()带有油菜叶绿体 16SrRNA基因 GaoJiaguoetal.:AMethodforRapidIdentifi- cationoftheSize of the Delelants in DNA (1.5kb)的重组噬菌体的定向缺失 按Hong Sequencing 的方法进行[1]0 本文于 1988年7月20日收到。 图 1 童组噬菌体的定向随机缺失 a-P:缺失克隆;9:重组克隆;r:M13mpS, 图2示油菜16SrRNA荃因重组噬困体的系列缺失子 图3 图2中b,。、d缺失于的顺序分析 a:重组克隆;b-h:系列缺失子:isM13mp8, 是%RflioE*X定油菜 16SrRNA基因(1.5kb) 测定出油菜16SrRNA基因的顺序。 图3表 重组子的顺序过程中,利用细胞裂解电泳法

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