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如何使用命令行方式提交MS 的计算作业 Castep： 1．打开MS 界面，建立相关模型，并且在Castep 的Calculatiton 对话框中设置相关参数； 2 ．不要单击Run 进行Castep 计算工作，而要在Calculation 对话框中选择Files - Save Files ，此时会在Project Explorer 中出现一个新的目录，其中包括了使用命令行运行 Castep 的输入文件； 3 ．使用Windows 的文件管理器进入该目录(相关Project 名称.files\Documents 下) ，能够 看到所需要的输入文件。 注意，由于castep 计算所需的.cell 文件是隐藏文件，因此需要在“工具|文件夹选项” 中选择“显示隐藏文件”。 将以下文件拷贝到SGI Prism 的相关路径下， *.cell、*.param。 此外，需要将计算所需的赝势文件拷贝到SGI Prism 相关路径下。 （在CASTEP | Calculation | Electronic 的more 下 Potential 中可以看到所使用的赝 势文件，该文件的路径在 Windows 系统的MS 安装路径\MS Modeling 3.2\Data\Resources\Quantum\Castep\Potentials 中，请将所出现的赝势文件全部拷贝到 SGI Prism 机器上，否则会导致计算失败） 4 ．使用帐号登陆到SGI Prism 下，进入相关文件夹（文件夹中包括刚才所有的文件）， 并执行命令： chmod 777 *.* /home/msi/ms/CASTEP/bin/RunCASTEP.sh -np n seedname 注：-np 表示使用多CPU 进行并行运算； n 表示所使用的CPU 数目 seedname 表示计算作业的名称，例如相关参数文件为Al.param ，则Seedname 为Al ，不带后缀名 5 ．计算完成后，请将该目录中所有的文件下载到本地机器上，并放到刚才在Visualizer 下新建的目录中； 6 ．在Visualizer 的Project Explorer 中单击右键，选择刷新，即可看到刚才所有计算得 到的结果，并可在MS 中进行分析。 3 DMol 1．打开MS 界面，建立相关模型，并且在DMol 的Calculatiton 对话框中设置相关参数； 2 ．不要单击Run 进行DMol#计算工作，而要在Calculation 对话框中选择Files - Save Files ，此时会在Project Explorer 中出现一个新的目录，其中包括了使用命令行运行 3 DMol 的输入文件； 3 ．使用Windows 的文件管理器进入该目录(相关Project 名称.files\Documents 下) ，能够 看到所需要的输入文件。 注意，由于DMol3 计算所需的.car 和.mdf 文件是隐藏文件，因此需要在“工具|文件 夹选项”中选择“显示隐藏文件”。 将以下文件拷贝到SGI Prism 的相关路径下， *.car、*.mdf、*.kpoints、*.input。 4 ．使用帐号登陆到SGI Prism 下，进入相关文件夹（文件夹中包括刚才所有的文件）， 并执行命令： chmod 777 *.* dos2unix *.* (将ASCII 码格式文件转换为UNIX 格式) /home/msi/ms/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np n seedname 注：-np 表示使用多CPU 进行并行运算； n 表示所使用的CPU 数目 seedname 表示计算作业的名称，例如相关参数文件为Al.input ，则S