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利用SSR和SFP标记分析不同抗瘟性水稻品种的多态性.pdf
第 36卷第3期 湖南农业大学学报(自然科学版) Vo1.36No.3
2010年 6月 JournalofHunanAgriculturalUniversity(NaturalSciences) Jun.2010
DoI:10.3724/SP.J.1238.2010.00267
利用 SSR和 SFP标记分析不同抗瘟性水稻品种的多态性
黄玲 ,黄红梅 。,肖应辉 ,刘雄伦 ,刘二明 ,戴 良英
(湖南农业大学 a.农学院;b.生物科学技术学院;c.生物安全科学技术学院,湖南 长沙 410128)
摘 要:利用914对引物(848对SSR引物和66对SFP引物),对籼型广谱持久抗瘟水稻品种湘资3150和籼型
感病品种CO39的基因组多态性进行研究.结果表明,881对引物(815对SSR引物和 66对 SFP引物)有扩增产物 ,
扩增率为96.39%.共筛选到220对多态性引物 ,多态性检出率为24.10%.SSR标记的多态性检出率为23.58%,
低于 SFP标记的多态性检出率(30.3O%).不同染色体间多态性检出率差异较大,第 10染色体的供试引物多态性
检出率最高,为 30%;第 9染色体的多态性检出率最低,为 14.55%.不同碱基数 目基序的标记问多态性检出率
有较大差异,其中4碱基重复型的多态性检出率最高,为27.96%,其后依次为2碱基重复型、复合型、3碱基重
复型和单碱基重复型.
关 键 词:水稻;微卫星标记;SFP标记;稻瘟病抗性;多态性
中图分类号:S511.035.3;Q78 文献标志码:A 文章编号:1007.1032(2010)03.0267.05
Polymorphism analysisofdifferentricevarietieswithSSR andSFPmarks
HUANG Ling,HUANG Hong.mei,。,XIAOYing.hui,LIU Xiong.1un,LIU Er-ming。’DAILiang—ying。
,
fa.CollegeofAgronomy;b.CollegeofBioscienceandBiotechnology;c.CollegeofBio—SafetyScienceandTechnology,
HNAU,Chnagsha410128,China)
Abstraet:914marks(848SSRnad66SFP)wereusedtofindthegenomicpolymorphismbetweentheblastresistnatrice
varieyt Xiangzi3150andtheblastsusceptiblevarieyt CO39.Theresultsshowedthatexpectedbandswereamplified
from96.39%of881markers(815SSRand66SFP),amongwhich220polymorphictagswereidentifiedand24.10%
were.ThepolymorphismrateoftheSSRmrak(23.58%1waslowerthna thatoftheSFPmrak(30.3O%1.Therateof
polymorphicmrakson the 12chromosomeswasdifferent.Chromosome 10hadthehighestrate(30.0O%1nad
chromosome9hadthelowestrate(14.55%、.SSRmrakswithdifferentunitsalSOshowedasignificantdifferencein
polymorphismrate.TheSSRmrakswihttetranucleotiderepeatshadthehighestpolymorphismrate(27.96%),f
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