大鲵虹彩病毒-LY株主要衣壳蛋白基因克隆和分子特征研究.pdfVIP

中国磨亏通搪 2015，31(5)：45—54 ChineseAgriculturalScienceBulletin 大鲵虹彩病毒一LY株主要衣壳蛋白 基因克隆和分子特征研究 周小愿，张星朗，韩亚慧，贾秋红，高宏伟 (中国水产科学院黄河水产研究所，西安710086) 摘 要：为明确大鲵虹彩病毒一LY株主要衣壳蛋 白(mcp)基因分子特征和中国不同CGSIV毒株mcp基因 变异及病毒的系统进化关系。克隆了CGSIV-LY株mcp基因，并运用生物信息学软件对获得的基 因信 息进行了分析。结果表明CGSIV-LY株mcp基因全长1392bp，可编码463个氨基酸。预测蛋白质分子 量为50．03ku，理论等电点是5．75，为亲抽}生可溶蛋 白。CGSIV-LY株mcp不合有信号肽；没有跨膜区存 在 ；抗原表位预测显示抗原性 良好 ；结构预测显示，存在8个潜在的N．糖基化位点，存在 17个潜在的 O一糖基化位点和20个潜在的磷酸化位点。CGSIV-LY株mcp二级结构中无B．折叠，无规则卷曲占 57．66％，延伸链 占31．11％，仅一螺旋 占l1．23％，主要 以延伸链和无规则卷曲为主。氨基酸序列包含3个结 构域：氨基酸N末端，氨基酸c末端和capsidNCLDV保守区结构域，并在氨基酸序列的第414-436区存 ． 在一个低复杂度域。氨基酸序列多重比对和基于mcp氨基酸序列构建的蛙病毒属成员系统进化树分析 结果显示，包括CGSIV-LY株在 内的中国出现的不同CGSIV毒株之间mcp基因差异很小，为平行进化关 系，共同聚为蛙病毒属成员独立的一支。中国出现的不同CGSIV毒株mcp基因应具有基本一致的分子 结构和特征。 ， 关键词：大鲵；虹彩病毒；主要衣壳蛋白；克隆；结构预测 中图分类号：Q941 文献标志码 ：A 论文编号：2014—1661 GeneCloningandMolecularCharacteristicsofMajorCapsidProteinfrom ChineseGiantSalamanderrAndriasdavidianus)Iridovirus-LYIsolate ZhouXiaoyuan，ZhangXinglang，HanYahui，JiaQiuhong，GaoHongwei (Yellowriverfisheriesinstitute，CAFS，Xi’an710086) Abstract：Theobjectivesofthisstudyweretoanalyzethemolecularcharacteristicsandstruetureofmajor capsidprotein(mep)fromChinesegiantsalamanderiridovirus(CGSIV)一LYisolate，geneticvariationofmcp from differentCGSIV isolatesinChinaandtheevolutionofCGSIV．ThecompleteDNA ofmcpfrom CGSIV- LY strainwasclonedthroughPCR amplificationandthenthemolecularcharacteristicsofmcpwerestudiedby meansofbioinformicssoftware，andphylogenetictreewasconstructedbygeneticdistances．Thelengthofthe mcpgene，encoding463aa，was1392bp，Themolecul