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1.研究目的
抗菌肽被称为天然抗生素,是宿主产生的一类可抵抗外界病原体感染的小分子阳离子肽,广泛存在于昆虫、植物、动物及人体内。与传统抗生素相比,抗菌肽具有广谱抗菌活性、快速杀菌能力、不易产生耐药突变株的优势,同时还可选择性杀伤一些肿瘤细胞。但是,抗菌肽在自然界中很难获得其天然提取工艺复杂且资源有限,化学合成也存在成本高、大批量生产困难的不足。昆虫细胞表达系统具有高等真核生物表达系统的优点可以对表达蛋白进行翻译后修饰,有效地转录和翻译外源基因,较好地完成糖基化、磷酸化、二硫键形成等加工修饰过程,较客观地表达天然蛋白质的结构并维持其生物学活性。将重组杆状病毒感染昆虫蛹及幼虫,可使抗菌肽在昆虫的血淋巴中自动富集,简化了收获抗菌肽的过程(Hellers et al. 1991)。昆虫杆状病毒表达系统表达抗菌肽Shiva-1a的基因,并对抑菌活性进行研究,为选择合适的基因工程的方法高效率表达抗菌肽提供一定的思路,同时也为转基因动物的抗病育种提供候选基因和理论基础。
3.具体研究方法,步骤并截图说明
3.1人类ALR基因mRNA的fasta文件输出
打开NCBI的Map Viewer Home网页,如图(1)在列表框中选择nucleotide,然后在文本框中输入我要的目的基因shiva-1a
图(1)
目的序列:
ORIGIN
1 ggatccccag tcgacaacga caaaatagta cctcaagctc aacaagcatt ttaggtgtcc
61 ttagcttact atttctctgg ctaactgtat gaagccatct atcaccctgt gtgcaattag
121 ctcattgtgt agataagaag gtaaaaccat cttgaaacag gaaaccaata tccttcctgt
181 ctaatcaaca aatctaaaag atttattctt ttcatctatc tcctcttgcg tttgtccacc
241 acaacaggct gcttacaggt tcaggatggt tttgacaaag agaacatttt catgagttac
301 ttttgtgtct ccaccccaaa gaggaaaatt tgtttcatac agaaggcgtt cattgtatga
361 attaaaactg ccacctaagt gtgggctaac ccgaccaaga gggatttcac ctaaatccat
421 tcagtcagtg tatgggggtt taaagaaatt ccagagagtc atcagaagag gaaaaacaaa
481 ggtaatgctt tctgccacac aggtagactc tttgaaaata tgtgtaatat gtaaaacatc
541 gtgacacccc catattattt ttccagcatt aacagtataa attgcctccc atgctgaaga
601 gctgcctatc acccttgcta atcactcctc acagtgacct caagtcctgc aggcatgtac
661 agcatgcagc tcgcatcctg tgtcacactg acacttgtgc tccttgtcaa cagcgcaaga
721 tctaccatgc cgcgctggcg tctgttccgc cgtatcgacc gtgttggcaa acagatcaaa
781 cagggtatcc tgcgtgctgg cccggctatc gctctggttg gcgacgcccg cgcagttggt
841 tgagaattcg aatggccatg ggacgtcgag ggatctttgt gaaggaacct tacttctgtg
901 gtgtgacata attggacaaa ctacctacag agatttaaag ctctaaggta aatataaaat
961 ttttaagtgt ataatgtgtt aaactactga ttctaattgt ttgtgtattt tagattccaa
1021 cctatggaac tgatgaatgg gagcagtggt ggaatgcctt taatgaggaa aacctgtttt
1081 gctcagaaga aatgccatct agtgatgatg aggctactgc t
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