大肠埃希菌耐药相关基因和可移动遗传元件指标与样本聚类分析.pdfVIP

大肠埃希菌耐药相关基因和可移动 遗传元件指标与样本聚类分析 黄东标 徐素兰 周茂亮 胡晓燕 马拥军 孔海深 [摘要] 目的 调查多重耐药大肠埃希菌耐药相关基因与可移动遗传元件的相互关系，以及菌 株间的亲缘性关系。方法 收集浙江省磐安县人民医院2009年6月-2010年6月临床分离的多重 耐药大肠埃希菌共20株，采用聚合酶链反应(PCR)分析β-内酰胺类与氨基糖苷类耐药相关基因以 及可移动遗传元件，并对检测结果作指标与样本聚类分析。结果 20株多重耐药大肠埃希菌共检出 4种β-内酰胺类耐药相关基因,4种氨基糖苷类耐药相关基因，以及5种可移动遗传元件的遗传标 记。指标聚类分析显示，耐药基因TEM、CTX-M-1、aadA5与可移动遗传元件traA、IS26、ISEcpl相关 联，耐药基因OXA-1、aac(6′)-Ⅰb、ant(3″)-Ⅰ、rmtB与可移动遗传元件trbC、IS903相关联。样本聚类 分析显示，本院20株耐药大肠埃希菌可分为两个群，并且两群菌株演化明显。结论 多重耐药大肠 埃希菌耐药相关基因与可移动遗传元件有关，对菌株进行样本聚类分析可获得菌株亲缘性关系，对控 制医院感染意义重大。 [关键词]大肠杆菌；抗药性；β-内酰胺类；氨基糖苷类； 可移动遗传元件；指标聚类 分析；样本聚类分析 Correlationbetweendrug-resistantgenesandmobilegeneticelementsinmulti-drugresistant Escherichiacoli HUANGDong-biao* XUSu-lan ZHOUMao-liang HUXiao-yan MAYong-jun KONGHai-shen. *DepartmentofClinicalLaboratory,PananPeoplesHospital,Panan322300, ZhejiangProvince,China [Abstract] Objective Toinvestigatethecorrelationbetweendrug-resistantgenesandmobile geneticelementsinmulti-drugresistantEscherichiacoli,andtoexplorephylogenyamongthestrains. Methods Totally20strainsofmulti-drugresistantEscherichiacoliwerecollectedfromPananHospital, ZhejiangProvinceduringJune2009andJune2010.Beta-lactam-resistancegenes,aminoglycoside-resistance genes,geneticmarkersofmobilegeneticelementswereanalyzedbyPCR.Indexandsampleclusteranalysis wereperformedonaboveresults. Results In20strainsofEscherichiacoli,4kindsofbeta-lactam resistancegenes,4kindsofaminoglycoside-resistancegenes,and5kindsofgeneticmarkersofmobile geneticelementsweredetected.Indexclusteranalysisshowedthatcorrelationexistedbetweenresistance genesTEM,CTX-M-1,aadA5andmobilegeneticelementstraA,IS26,ISEcpl;andcorrelationalso existedbetweenresistancegenesOXA-1,aac(6′)-Ⅰb,ant(3)-Ⅰ ,rmtBandmobilegeneticelements trbC,IS903.SampleclusteranalysisshowedthatthisgroupofEscherichiacolicouldbedividedinto2groups whichweregeneticallydifferent.Conclusions Drug-resistantgenesinmulti-drugresistantEscherichiacoli arecorrelatedwithmobilegeneticelements.Sampleclustera