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网格系统使用说明
目录
一、网格系统组成 2
二、主要软件 2
三、运行程序的方法 4
四、如何运行已安装的程序5
五、如何运行自己编写的程序 8
六、如何开户 13
1
一、网格系统组成
网格系统主要由曙光集群计算机、HP 集群计算机、HP SMP 大型机、GPU 集群、存储系统组成。
曙光集群计算机:峰值计算能力为 19.64TFlops,包括 93 个计算节点,每个节点 2 个CPU,每个 CPU12
核,主频 2.2GHz,节点内存 32GB。节点由 40Gbps的 IB 交换机互联。
HP 集群计算机:峰值计算能力为 2.3Tflops,包括 76 个计算节点,每个节点 2 个 CPU,每个 CPU2
核,主频 2.2GHz,节点内存 4GB,节点由 10Gbps 的IB 交换机互联。
SMP 大型机:包括 42 个 1.5GHz 64 位安腾 2 CPU、196GB 内存。
GPU 集群:峰值计算能力为单精度 6.18TFlops,包括主机及 6块Tesla C2050 GPU 卡,主机为 Intel
Xeon 4核 CPU,主频为 2.4GHz,内存为 32GB,硬盘为 300GB。
存储系统:可用容量约为 30TB,由集群、大型机和 GPU 系统共享。
曙光集群和 HP 集群可作为统一系统,运行用户的程序。
网格系统的逻辑结构如图 1 所示。
校园网
曙光集群 HP 集群 SMP 大型机 GPU集群 存储系统
图 1 网格系统示意图
二、主要软件
1.操作系统:集群的计算节点安装 64 位SuSe11 Linux 系统,其中曙光集群的 10 个节点通过虚拟机
同时安装 Windows Server2008,双操作系统同时运行。SMP 大型机安装 HP-UX 系统。GPU主机安装 SuSe11
Linux 和Windows Server2008,双操作系统同时运行。
2.编译系统:集群上安装 C/C++、FORTRAN 编译系统、MPI 和MPICH库。SMP 大型机上另外安装 OpenMP
库。GPU 集群安装有 CUDA C 编译系统
3.作业调度系统:Platform 公司的LSF。
2
4.应用软件:已安装可直接运行的应用软件如表 1 所示。
表 1 应用软件一览表
运行
学科 子分类 软件名 版本 操作系统
平台
vasp 4.6.35 64bit Linux 集群
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