血清蛋白质指纹图谱用于胃癌早期诊断地研究.pdfVIP

血清蛋白质指纹图谱用于胃癌早期诊断地研究.pdf

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融 论文汇编 恸 AC一6 血清蛋白质指纹图谱用于胃癌早期诊断的研究 薛文成①冯 凯。孟冬娅①郑燕华。张建中。康辉。辛彦④ ①中13t人民解放军沈阳军区总医院检验科②中国人民解放军306医院中心实验室③中国医科大学第一附属医院检验科 胃癌是对我国人民构成严重威胁的疾病之一.其发病率为 20/10万左右,死亡率在我国居癌症死亡率的第2位。胃癌患者不 良预后主要是由于不能早期诊断.中晚期胃癌治疗的局限性等因 素所致。目前依靠胃镜检查是发现早期胃癌的有效手段,但胃镜 5min,甩于;再用HPLC H20洗涤一次,立即甩干。拆开biopro. 检查存在诸多不便。寻找一种简单易行、灵敏度高、特异性强的早 cessor,取出芯片,晾干后,每点点加2次0.5斗lSPA。晾干后即可 期胃癌诊断方法是当务之急。血清学指标筛选是较为理想的手 上机测量。 段。遗憾的是。迄今为止仍未找到可靠有效的早期胃癌血清学标 1.5数据采集,处理 志分子。进来。表面增强激光解吸附离子化/时间一飞行质谱分析 的血清蛋白进行读取分析.设定最高检测分子量为50kD。优化范 (SELDI/rOF—MS)与蛋白质芯片技术结合使用的技术广泛用于肿 瘤标志物的筛选f1。2。31,本研究拟应用SELDDTOF—MS和蛋白质 芯片技术外加模式匹配运算法则探讨该技术用于早期胃癌诊断 滤去。采用Ciphergen 的可行性。 据,用质谱峰下面积表示蛋白质丰度。 1材料与方法: 以30例胃癌(10例早期、14例进展期、6例伴远隔脏器转 1.1临床病理资料 Pat. temsSoftware建立早期胃癌预警决策树分类器模型.用盲筛方法 研究对象:57例胃癌患者男:女41:16;年龄42~84岁,平均 检测其它未参加建模的患者及健康者。以验证上述早期胃癌分类 年龄60±15.3岁:临床病理分期:早期19例,其它38例;转移情况: 进展期胃癌患者仅3例未见淋巴结转移.其余均伴淋巴结转移; 模型的实用性。 伴脏器转移11例:肝转移9例,卵巢转移1例,肾转移1例。上述 1.6统计学分析 Wizard软件对数 胃癌患者病理资料均由术后系统病理诊断证实,由胃镜、病理诊断 采用CiphergenProteinchip3.1及Biomarker 据进行统计学处理。PO.05视为差异显著。 确诊的胃良性病患者7例。健康人26例,男:女18:8,年龄35。78 岁,平均年龄49±18.2岁,来源于肝功、肾功等检查均正常的体检人 结果 群。 1.早期胃癌决策树分类器模型构建 血清标本采集:所有患者于接收治疗前早晨空腹采集静脉 实验共获取早期胃癌与正常对照组之间的49个差异蛋白质。 血3Illl,静置凝结。待分出血清后。于2500rpm离心5min,分装血 清。冻存于一70℃冰箱中备用。 正常对照作为训练组.上述49个差异蛋白质峰为基础.建立决策 1.2主要试剂 树分类器模型.下面选择对早期胃癌分类效果较好的三个模型将 尿素、乙腈、三氟乙酸、’Ks—HCl pH9.0、CHAPS、DTY、NaAc、 HPLC H20、Hepes等均购自Sigma公司。 1.3仪器

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