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不同生活习性下原核生物基因组大小与GC含量的关系研究.pdf
第50卷第3期 中山大学学报(自然科学版) Vbl.50No.3
201 ACTASCIENTIARUMNATURALIUMUNIVERSITATISSUNYATSENI 2011
1年5月 May
不同生活习性下原核生物基因组大小与
GC含量的关系研究+
林瀚,黄亚志,张尚宏
(中山大学基因工程教育部重点实验室∥生物工程研究中心,广东广州510275)
摘 要:对原核生物基因组的研究显示,基因组Gc含量与基因组大小和氧气偏好性等因素存在着一定的相关
性。为了探索基因组大小与Gc含量的相关性是否受原核生物生活习性的影响,选取了有代表性的411种原核生
物(包括古细菌与真细菌),分别从最适生长温度、氧气偏好性、运动特性、水生特性和寄生特性等因素进行分
析,发现基因组大小与C—C含量的相关性确实受这些因素的影响,而寄生原核生物中显示出最好的相关性。
关键词:原核生物;基因组大小;Gc含量;生活习性;相关/回归分析
中图分类号:Q754文献标志码:A 文章编号:0529—6579(2011)03—0090—04
CorrelationGenomeSizeandGCContentin
Between
withDifferent
Prokaryotes Lifestyles
LIN
Han,HUANGYazhi,ZHANGShanghong
ofGene of ofEducation Research
(TheKeyLaboratoryEngineeringMinistry ffBiotechnologyCenter,
SunYat—sen 510275,China)
University,Guangzhou
of haveledtothe ofthecorrelationof GC
Abstract:Researches
prokaryoticgenomes discovery genomic
contentwit}l sizeandaerobics/anaerobics.Inorderto theinfluenceof of
genome study lifestylepro—
size GC theeffectof
onthecorrelationbetween and
karyotes genomiccontent,we opti-
genome analyzed
mal datafrom411
growthtemperature,aerobics/anaerobics,motility,aquatics,andparasitism,using
archaeaand
representativeprokaryoticspecies(includingbacteria)andcorrelation/regressionapproa—
ches.Theresultsshowthatt
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