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人DNA甲基化转移酶3B1真核表达载体的构建和鉴定_临床医学论文.doc
人DNA甲基化转移酶3B1真核表达载体的构建和鉴定_临床医学论文
人DNA甲基化转移酶3B1真核表达载体的构建和鉴定_临床医学论文
作者:姜树原 邵国 张胜 黄丽华 龚向峰 周立社
【摘要】 目的:构建人DNA甲基化转移酶3B1(DNMT3B1)真核表达载体pCMV-DNMT3B1。方法:根据Genebank中人DNMT3B1 cDNA序列设计并合成特异性引物,提取HCT116细胞总RNA,利用PCR技术扩增出DNMT 3B1,并将扩增产物克隆到真核表达载体pCMV-2B中。结果:PCR扩增得到人DNMT3B1的cDNA片段大小为2.6 kb,重组子利用限制性内切酶进行酶切、PCR鉴定和DNA序列分析得到真核表达载体pCMV-DNMT3B1。结论:成功构建了人DNMT3B1真核表达载体,为进一步研究DNMT3B1提供了条件。
【关键词】 DNA甲基化转移酶3B1;构建;鉴定
Abstract Objective: To construct and identify the eukaryotic expression plasmid for human pCMV- 2B-DNMT 3B1. Methods: Accord to the published human cDNA sequence in Genebank, a pair of primers were respectively designed and synthesized. The total RNA was isolated from HCT116 cell. After amplification with reverse transcription polymerase chain reaction (RT - PCR), the product was cloned into pCMV- 2B vector. The recombinants were finally sequenced and identified by restrictive endonuclease digestion. Results: pCMV-DNMT3B1 eukaryotic expression vectors was successfully constructed, and it was identified by PCR, double restrictive endonuclease digestion and sequence analysis. Conclusion: The DNMT 3B1 eukaryotic expression vectors was successfully constructed and identified.
Key words DNMT 3B1; Construction; Identification
DNA甲基化是真核基因组修饰的一种重要方式,DNA甲基化出现于CpG二核苷酸中的胞嘧啶上[1]。真核细胞DNA甲基化由DNA甲基化转移酶(DNMT)催化,目前发现的DNMT有DNMT1、DNMT2、DNMT3A、DNMT3B及DNMT3L,其中DNMT1为维持型甲基化酶,DNMT3A和DNMT3B为从头合成型甲基化酶,DNMT3L单独没有活性,但其可以与DNMT3A或DNMT3B相互作用而调节其活性,目前还没有DNMT2的具体功能的报道。在Peter John研究小组的文章中指出,癌症病人样本中发现5/10的DNMT3A上调、6/10的DNMT1上调、8/10的DNMT3B上调,且DNMT3B上调的幅度最大,与对照相比,平均增加7.5倍。因此,DNMT3B在癌症的发生中可能有重要作用[2]。我们成功地构建了DNMT3B1的真核表达载体,为进一步研究DNMT3B的功能奠定了基础。
1 材料与方法
1.1 主要材料和试剂
HCT116细胞购于上海细胞所,Trizol购自GIBCOBRL公司,反转录试剂盒购于invitrogen公司,限制性内切酶EcoRⅠ和BamHⅠ购于Takara公司,Expand High Fidelity PCR System及rapid ligation Kit购于Roche公司,DNA回收试剂盒购于Qiagen公司。
1.2 方法
1.2.1 总RNA提取
将人HCT116细胞在培养皿中培养至对数生长期,用冷PBS洗涤后,每孔加入Trizol 1mL,吹打均匀后加入200 μL氯仿,混匀,4 ℃、12 000 rpm离心15 min,取上清液,然后加入500 μL异丙醇沉淀,混匀后,室温放置10 min,4 ℃、12 000 rpm离心10 min,沉淀物用70 %乙
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