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第30卷第4期 杭州电子科技大学学报 Ⅷ.3D.№.4
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多焦点多光子显微成像经典数据压缩应用研究
TCS02
王瑞荣1,何峰1,丁颖1,金朝阳1,王建中1,薛安克1,Peter
(1.杭州,1已5-科技大学自动化学院,浙江杭州310018;2.麻省理工学院机械工程系,马赛诸萨州02139)
摘要:该文针对多焦点多光子显微镜被越来越多地用于生物组织的三维成像。由于三维成像的实
时图像数据巨大,开发实时压缩算法将有助于大规模图像数据的采集和存储。基于霍夫曼编码的
元损压缩算法和基于离散余弦变换的JPEG有损压缩算法,对多焦点多光子显微镜成像数据的压
缩进行初步研究。实验结果表明,基于霍夫曼编码的无损压缩算法压缩率稍低,但无图像信息丢
失;基于JPEG编码的有损压缩算法具有较高的压缩率,但是图像信息会有一定程度的丢失。
关键词:
多焦点多光子显微镜;霍夫曼编码;无损压缩;有损压缩
中图分类号:TP391.4 文献标识码:A 文章编号:1001—9146(2010)04一0040一05
0引言
多焦点多光子显微镜(Mulfifocal
MultiphotonMicroscopy,枷垤M)是当今世界上最为有效的生物组织三
维成像技术之一。它较之传统的双光子显微镜[1l(Two—PhotonMicroscopy,硎)成像速度更快,且其成
像深度与对比度的效果也明显提高。然而,这种发展从另一个方面也造成了其成像的显微图像数据量
变得越来越巨大,解决这类问题的关键技术之一就是图像压缩技术。
l多焦点多光子显微镜成像原理
多焦点多光子显微镜的基本结构除了光学显微镜部分外,还包括激光光源、光路聚焦装置、扫描装
置、分光装置与检测装置等部分。其多焦点多光子显微镜成像系统原理图[11以多阳极光电倍增管作为
图像采集装置,是因为其在深度成像时所采图像的对比度要优于采用图像传感器所作为的图像采集装
liE21。
2经典图象压缩方法
2.1基于HutIman编码图像无损压缩方法
无损压缩,是指图像在经过压缩、解压后的图像与原始图像完全相同,没有任何信息的损失。无损
压缩算法可以分为两类:基于统计特性的方法和基本字典的技术【3J3。本文中将采用Huffman编码方法,
这是一种典型的基于图像信息统计特性的无损数据压缩编码【4J。
Huffman编码的实现方法现简要概括如下:
(1)把输入元素按概率由大到小排列,然后把最末两个最小概率的元素之概率相JJ【l;
’(2)把该概率之和同其余概率由大到小排队,再把两个最小概率相加,再重新排队;
(3)重复(2),直到最后只剩下两个概率为止;
(4)从最后两个概率开始从右向左编码。对概率大的赋“O”,对概率小的赋“1”;
收稿日期:20lO一∞一3l
基金项目:国家自然科学基金资助项目
作者简介:王瑞荣(1972一),男,浙江义乌人,副教授,控制科学与工程.
第4期 王瑞荣等:多焦点多光子显微成像经典数据压缩应用研究 41
(5)寻找从每一个新源符号到概率“l”处的路径,记录路径上的“1”和“0”;
(6)写出每一符号的“1”、“0”序列形成每一个符号的Huffman码字。
2.2基于JPEG标准的有损压缩方式
有损压缩,图像的有损压缩是以图像重构的准确度上做出让步而换取压缩能力增加的概念为基础
的。连续色调静止画面压缩标准之一的联合图像专家组L5J(JointPhotographicExperts
Group,JPEG)标准
Cosine
是将一副图像采用离散余弦变换(Di
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