石磺科贝类线粒体基因组全序列研究现状与展望.pdfVIP

石磺科贝类线粒体基因组全序列研究现状及展望 魏峦峦，沈和定 (上海海洋大学水产与生命学院，201306) 摘要：动物线粒体基因组全序列(mtDNA)是核外遗传物质，基因组较小，且基因结构及基因 排列简单，多个拷贝，易于分离；物种内没有基因重排，非编码序列少(D．100p除外)，广 泛用于分析动物类群间的系统关系。软体动物mtDNA为典型的环状双链分子，长度大多在 1和18 ATP6和ATP8)、22个tRNA、以及12Sr】卧IA和16srRNA。软体动物的mtDNA基因排列和基 因含量是不保守的，存在大量基因重排。因此软体动物线粒体基因组是系统进化研究很好的 材料，其优越性是其他动物类群难以比拟的。目前，已报道的mtDNA的基因组共有66种， 如太平洋牡蛎(Crassostreavirginica)、三角帆蚌(HyriopsiscumingiO、森林葱蜗牛(Cepaea nemoralis)、黑唇鲍(Haliotisrubra)等。有关软体动物系统发育及其分类学研究虽然有了 很大进展，但目前对软体动物的自然分类系统尚有不同的见解和看法，诸多研究工作还有待 开展。 传统的线粒体DNA基因组全序列研究是通过设计出能覆盖全基因组的多对引物，采用 常规PCR技术直接从总DNA中进行扩增，形成一系列长度短于5kb的DNA片段并拼接出一个 完整的基因组序列。而长PCR技术(LA-PCR)则克服了传统的PCR技术扩增片段短、保真 性低的缺陷，可扩增出5～42kb长的大片段并且具有高保真性的特点；由于目前尚未建立起标 准化的操作模式，需要针对不同的情况做适当优化、序列测定费用高等缺点使得长PCR技术 未能得到广泛应用。国内外学者应用长PCR技术已扩增出了哺乳类、鸟类、爬行类、鱼类、 节肢动物等线粒体基因全序列，但国内有关软体动物的线粒体基因组鲜有报道。 石磺科(Onchidiidae)贝类多生活在海洋与陆地及淡水连接的潮问带上部及潮上带，在 研究贝类由海洋向淡水及至陆地演化、软体动物系统分类学、物种多样性等方面具有十分重 要的意义，但长期以来我国石磺科贝类的分类研究没有得到应有的重视，导致国内石磺科贝 类的分类、命名工作滞后，严重影响了国际学术交流及高质量论文的发表。因此将形态学和 分子生物学技术相结合可对系统发育及其分类学研究产生重要的推动作用。通过长PCR技术 我们已经将石磺科线粒体基因组扩增为2个或几个相互重叠的DNA大片段，并计划对所有石 磺科属种的线粒体基因组进行分析，以期为石磺科贝类系统分类提供基础资料，能为种质资 源的保护以及贝类mtDNA基因重排和基因进化过程研究提供一个重要模型和良好依据。 关键词：软体动物；系统发育：线粒体DNA基因组 基金项目：国家自然科学基金资助项目，上海市教委重点学科项目资助(J50701)。 作者简介：魏峦峦(1985-)，女，上海海洋大学硕士研究生，研究方向：海洋生物学；E．mail： weiluanluan@126．com． 通讯作者：沈和定，Tel：021E·mail：hdshen@,shou．edu．cn。