农业院校生物信息学本科教学的实践与心得.pdfVIP

高校生物学教学研究 (电子版)2015年3月，5 (1)：20-23 ISSN 2095—1574 CN 11-9307／R bioteach．hep．com．cn 教 改纵横 DOI10．3868／i．issn2095-1574。2015．01．018 农业院校生物信息学本科教学的实践与心得 吕巍，李滨 冈‘ 山东农业大学生命科学学院，泰安，271018 摘 要：通过分析农业院校生物信息学本科教学中出现的具体问题，为不断提高课堂教学的针对性与实效性，强 调实践教学的普及性与实用性，本文从以下三方面进行教学探索：①通过对现有生物信息学教材进行总结，针对 农业院校学生的特点，自主编写了教学大纲及教学内容；②根据农业院校的人才培养 目的和学生的专业特色，设 定课程的教学内容 ，从而做到因材施教；③加强实验教学内容，改革考核方法。 关键词：生物信息学，课程教学，实验教学 Practiceand InsightofUndergraduateEducation ofBioinformaticsin Agri- culturalUniversity LV W ei，LIBin() SchoolofLfieSciences，ShandongAgriculturalUniversity，Taian271018，China 1 引言 2 生物信息学课程教学的问题与挑战 随着人类基 因组工程 的顺利完成 ，植物全基 因 2．1 教材针对性较差、时效性较低 组测序 的工作也进展迅速 ，除了拟南芥 、苜蓿等模 式植物的全基 因组测序完成外 ，大豆、水稻、玉米、 近年来 ，随着生物信息学在 国内的不断发展，其 小麦等重要的农作物以及番茄、马铃薯等重要经济作 在本科教育领域的重要性越来越被大家认可，介绍和 物的全基因组测序工作也已完成。与此同时，计算机 讲授生物信息学的书籍 也不断涌现 ，但是由于编者 科学无论在硬件还是软件方面都有了质的飞越。因此 的学科背景不 同，各种专著的侧重点和针对性也不尽 人们开始应用计算机来存储和处理海量生物学数据 ， 相同。而在农业院校，大部分学生对生物学知识了解 并从 中提取有用的信息，如挖掘并识别农作物的重要 较多，而缺乏计算机及数学理论方面的知识，因此我 基因、发现新基凶、加快基因克隆等。这就要求农业 们的教学重点不应该放在算法的开发和研究上 ，而应 院校培养大量的了解农业知识 的生物信息学人材来完 该放在如何应用现有软件解决实际的生物学问题 卜。 成以上T作 。 另外，生物信息学是一 门前沿学科 ，不像数学、 物理一样属于理论基础课。随着生物技术的迅速发展 ， 生物学数据每年都会成倍增加，生物信息学的研究内 收稿 日期：2014—08—25；修 回日期：2014—12—25 容也随之增加 ，因此用一本或几本固定教材进行教学 基金项 目：2014年山东省自然科学基金 (ZR2014CQ055) 通讯作者 ：李滨 ，E—mail：sdaubio@163．com 势必造成时效性的下降。例如 ，绝大部分教材在介绍 吕巍等：农业院校生物信息学本科教学的实践与心得 21 已测序核酸碱基数时，还停 留在 2000年的60亿个碱 进行了改革与创新 ，力求最大限度地解决教材实用性 基 ，而现在的碱基数早已超过 1500亿。 差、学生专业基础及综合能力差距较大 ，以及实践课 程学时较少等困难。 2．2 学生的专业结构和理论知识差距较大 3．1 结合专业特点，因材施教 作为一所以