微生物蛋白质组学探究进展.pdfVIP

微生物蛋白质组学研究进展 刘先凯冯尔玲任静晓 军事医学科学院生物工程研究所北京100071 指”一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质”，而蛋白质组学(proteomics)是指根据 蛋白质种类、数量、局部存在的时间、空间上的变化来研究表达于细胞、组织及个体中的全部 蛋白质(protein)，并从其结构和功能的角度综合分析生命活动的一门科学。其目的是从整体的 角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态、了解蛋白质之间的相互作 用与联系，揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。而微生物蛋白质组学研究的基本目标是鉴定 与微生物活动相关的蛋白质。 1．蛋白质组学的技术体系 蛋白质组学研究的主要技术主要有3类，即蛋白质的分离、鉴定和生物信息学。蛋白质组 学研究的常规程序即样品制备一等电聚焦一聚丙烯酰胺凝胶电泳一考马斯亮蓝染色或者硝酸银 染色一胶内酶切感兴趣的蛋白质点一质谱分析确定肽指纹图谱或部分氨基酸序列一利用生物信 息学数据库确定蛋白。 2．微生物蛋白质组学的研究策略 微生物蛋白质组的研究策略主要有以下几种：一是表达蛋白质组学，即采用蛋白质组研究 技术分析微生物某一组分尽可能多乃至接近所有的蛋白质，建立其蛋白质组表达谱及其蛋白质 数据库；二是比较蛋白质组学，即采用蛋白质组学技术比较野生株和突变株在不同阶段同一组 分的蛋白质在表达数量、表达水平和修饰状态上的差异，发现相关的特异性蛋白质；三是免疫 蛋白质组学即采用免疫学与蛋白质组学相结合的方法寻找特异性相关抗原。 3．蛋白质组学在微生物中的应用 蛋白质组学在微生物中的应用颇广， 是微生物环境蛋白质组学的研究，即研究微生物在 极端环境(强酸、强碱、高温)下蛋白的变化，从而阐明微生物适应环境的分子机制，有助于 发现具有明显生物活性的蛋白分子，造福于人类；二是蛋白质组学在病原微生物中的研究，这 将对新药的开发和新疫苗的研制带来革命性的变化。目前研究最热的是病原微生物的耐药性。 由于蛋白质组学是在整体水平对生命活动作动态的全局的研究，因而它提供了研究微生物耐药 性一个强有利的工具，采用蛋白质组学方法对微生物耐药性的研究能够全面阐明微生物耐药性 机制，寻找新药物靶标，对于研制和筛选新的抗菌药物具有重要的意义；三是蛋白质组学在微 生物生理变化中的应用；四是蛋白质组学在微生物亚组分中的应用，进一步阐明微生物重要生 理过程的基本信息。随着蛋白质组学在微生物中的应用，将极大地推动微生物和医学的研究。