猪FTO基因的多态性检测及和经济性状的关联分析.pdfVIP

72 ofthe12thNational onAnimalGeneticMarkers Proceeding Symposium 猪F加基因的多态性检测及与经济性状的关联分析 韩雪蕾，蒋腾飞，崔晓刚，刘榜’ (华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，湖北武汉430070) 引言 FTO(Fatmassand associated obesity gene)基因，是一种与肥胖相关的候选基因，最早 是在小鼠中被鉴定的。位于小鼠8号染色体上，在该位置1．6Mb的缺失，可以导致Ft表型。 近年来，随着对FTO基因的研究，有多个单核苷酸多态性位点(SNPs)经研究证实与肥胖 有关，明确提出了FTO基因与肥胖症的关系。目前在体外的动物模型中对FTO基因功能的 研究不断有新的研究结果报道，充分说明了FTO在控制摄食行为和能量消耗方面起着重要 198Ala) 与背部膘厚和平均日增重有关的OTL。Fan等(2009年)人通过对c．594CG(Ala 和c．46—139AT突变位点进行研究发现，处于外显子3的c．594CG突变位点与腰部背膘 厚，大理石纹和肌肉总脂质百分量有呈显著相关。内含子l的c．46—139AT位点的SNPs 与平均日增重有显著的相关。本研究拟通过在试验群体中进行FTO基冈的SNP检测并与生 长和背膘厚性状的关联分析，为猪的标记辅助选择提供有用的分子标记。 材料方法 本研究中用于基因性状关联的群体为采集通城杂交群体和湖北天种畜牧股份有限公司 大白种猪群体，采集实验群体血样，用酚仿抽提法提取DNA。实验群体详细信息参照已发 和c．46一139AT突变位点的引物，利用PCR．RFLP方法分别进行检测在试验群体中的基因 型。然后用SAS软件中的一般线性模型进行不同位点与经济性状的关联分析。 结果 FTO基因外显子3c．594CG位点在通城杂交群体中与出生至上市体重，大理石纹，胸 腰椎膘厚和肌肉PH呈显著相关；两两比较结果显示：对于出生至上市体重和大理石纹，CC 基凶型个体与GG和GC基因型个体问差异极显著(P0．05)；对于胸腰椎膘厚，cc基因型 个体与GC基因型个体差异显著，对于肌肉PH，GG基因型个体与CC、GC基因型个体的 差异极显著；在大白种猪群体中与达lOOkg日龄和腰荐结合处膘厚旱显著相关。两两比较结 果显示：对于达100kg日龄，CC基因型个体与GG，GC基因型个体的差异显著(P0．05)； 对于腰荐结合处膘厚，CC基因型个体与GC基因型个体的差异显著(P0．05)。内含子 1c．46．139AT位点在通城杂交群体中与失水率，头重，臀部膘厚和屠宰率呈显著相关；对 AT与 于失水率，AT基因型个体与AA，TT基|大|型个体间差异显著(P0．05)，对于头重， AA基因型个体间的差异显著(尸0．05)。对于臀部膘厚，AA基因型个体与TT基因型个体 差异显著(P0．05)。对于屠宰率，AA基因型个体与AT、TT基因型个体的差异显著(P 0．05)。凶该突变位点在大白种猪群体中偏态，未进行经济性状的关联分析。 讨论 通过研究基因的变异并与性状间进行性状关联分析是目前探讨基因功能的一条途径，本 实验得出FTO基因多态性与胸腰椎和腰荐结合处膘厚呈显著相关(尸0．05)，等位基因G可 以降低背膘厚，为进一步探讨FTO基因的功能提供了研究基础 +本研究受国家高技术研究发展计划《2007AAlozl68)资助： 通讯作者：刘榜，研究方向：猪分子生物学与育种，E·mail：Ijubang@ma．1．hzau．edu．cn