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现代生物学及系统生物学理论与技术对药物研究的影响.pdf

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理蓼哙2008中国药理学会 娜∥药学发展前沿论坛 模检测的技术。在本研究中,我们进一步改进了所使用的探针的构建方法,使本方法 更加简便易行。 ,, 现代生物学及系统生物学理论和技术对药物研究的影响 李学军 北京大学基础医学院药理学系,北京100083 人类基因组计划完成之后,生物学领域出现了一个新兴的整合型大学科一系统生 物学,它集合了各种学科的力量,使人们对复杂的生命体系有更深刻地认识,而它必 将成为21世纪最具活力的生命学科之一。系统生物学的定义是研究一个生物系统中所 有组成成分(基因、mRNA、蛋白质等)的构成,以及在特定条件下这些组分间的相 互关系,并通过计算生物学建立数学模型来定量描述和预测生物功能、表型和行为的 学科。上世纪九十年代开始,兴起了许多组学研究,正是这些组学为理解系统结构积 累了大量的数据。 系统生物学在医学研究方面,将使用系统理论方法来解决复杂的生物系统,使医学 具有预测性和个性化:预测个体病人对特定疾病的易感性;寻找更有效的诊断和治疗 途径;为病人提供健康和预防疾病的个体化方案;如,利用基因多态性图谱预测病人 对药物的应答,包括毒副作用和疗效等。它将为现代重大疾病如癌症、艾滋和糖尿病 等的研究做出贡献。 系统生物学在新药发现领域的意义在于:加速药物的发现;加速靶点的发现与确 认;发现标志物跟踪临床疗效; 建立个性化用药方案;全面评价药物的毒副作用。基 于结构的柔性分子对接和虚拟配体筛选技术是基于系统生物学理论发现药物的一个重 要的手段,它能从化合物库中筛选出可能的先导化合物,并找到这些小分子与靶蛋白 结合的可能位点。但计算机方法常会产生太多的噪声,因此生物学研究如高通量药物 筛选(HTS)和高内涵要去筛选(HCS)因此会有更多的优点。从系统生物学的观 点,高通量选择靶点最好在细胞水平。成功的范例是通过建立EGF受体的网络模型结 合高效的筛选技术,找到了EGF受体抑制剂Hcrceptin和Iressa并使之成为新药。 143 ∥二酴2008中国药理学会 rI●,-I \!喇Z/药学发展前沿论坛 中医理论的辨证、整体和动态的观点与系统生物学的理论有共同之处。中医的基 础理论可以借用系统生物学的某些理论来解释。而中医理论又在一定程度上可以提供 思路去指导认识系统生物内部规律。西方医学比较关注特定疾病的病理学,注重特定 的器官结构的变化,治疗上主张采用选择性强的治疗药物,而中医强调个体的整个功 能状态,阴阳平衡,且中药的应用常为复方,强调整体调节。但中医理论缺乏对系统 内部各水平的认识,系统生物学则旨在将系统由“暗箱”变为“白箱”,揭示内部的组成成 分以及各成分间的动力学特征。 此外,现代生物技术也为中药的发展提供了极好的机会。在化学方面,将来需要以 天然产物(植物、微生物、海洋生物等)的基本骨架为主作结构优化。另外,现代中药 研究的中心问题是有效药物靶点的研究。应用蛋白质组学技术,对中药复方多组分的多 环节、多靶点进行研究,有望解释中药复方的作用机理。 July,2007, 《Nature》(12 Cultureinthe 448:126.128)刊出题为A Balance的文章,讨论了系统生物学在中医药研究 中的可能应用,介绍了上海交通大学系统生物医学研究院的研究进展。他们的研究显示 用代谢组学这样的系统生物学方法深入研究中医药作用机制具有巨大的潜力。 最近几年,

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