肉食螨论文：基于线粒体COⅠ和12SrRNA基因的常见肉食螨系统分析.docVIP

肉食螨论文：基于线粒体COⅠ和12SrRNA基因的常见肉食螨系统分析 【中文摘要】本论文基于线粒体COⅠ基因、12S rRNA基因对肉食螨亚科常见的3属5种肉食螨(马六甲肉食螨、强壮肉食螨、转开肉食螨、鳞翅触足螨及中华真扇毛螨)的系统关系进行分析,主要研究内容和结果如下：1、五种肉食螨的COⅠ基因系统分析对五种肉食螨的碱基组成研究发现,碱基组成存在明显的偏向性,A+T含量明显高于G+C含量,这一现象在其他无脊椎动物线粒体DNA序列中也普遍存在；对五种肉食螨的COⅠ基因序列进行对比,可以看出：在核苷酸位点中,没有插入、缺失及终止密码子出现,共检测到348个变异位点,179个简约信息位点。从mtDNA-CO I分子水平上对马六甲肉食螨与近缘种间的遗传关系的初步研究表明：马六甲肉食螨与强壮肉食螨亲缘关系非常近,两者遗传距离为0～0.039,属于马六甲肉食螨9个不同地理种群间的遗传距离范围内；从变异位点来分析,马六甲肉食螨与强壮肉食螨COⅠ基因序列差异非常小,共有44个变异位点,仅增加8个新的变异位点；从系统进化树来看,强壮肉食螨5个地理种群聚在马六甲肉食螨9个地理种群内,而不是独立成一支,并且采自同一地区的这两种螨首先聚在一起,然后不同地理种群的这两种螨聚在一起,再与转开肉食螨聚在一起,故认为强壮肉食螨与马六甲肉食螨差异是属于种内水平。在对肉食螨线粒体DNA的COⅠ基因序列进行测定和分析的基础上,对肉食螨亚科5种肉食螨包括肉食螨属3种、触足螨属1种和真扇毛螨属1种,构建了分子系统发育树,从NJ和MP树显示,拓扑结构一致,肉食螨科3个属间的系统关系为(肉食螨属+触足螨属)+真扇毛螨属；5种肉食螨的系统关系为{+鳞翅触足螨}+中华真扇毛螨。2、五种肉食螨的12S rRNA基因系统分析对五种肉食螨的12S rRNA基因部分序列进行测定和分析。扩增的片段在碱基组成存在明显的偏向性,A+T含量明显高于G+C,这一现象也在其他蜱螨类中普遍存在。马六甲肉食螨6个不同地理种群的基因序列仅有一个碱基的差异,转开肉食螨的2个地理种群没有差异,遗传分化程度很小,肉食螨属内不同种之间(遗传距离为0-0.047)和不同属之间(遗传距离为0.074-0.118)有一定的分化现象,并且置信度较高,表明12S rRNA基因序列适合作为肉食螨种间、属间系统发生研究的分子标记,预示该基因不适合用于肉食螨种下遗传分化的分子标记。基于12S rRNA基因分子水平上对五种肉食螨遗传关系的初步研究表明：马六甲肉食螨与强壮肉食螨亲缘关系非常近,同一地理种群的两种肉食螨的序列是完全相同的,而马六甲肉食螨与另外三种肉食螨在系统进化树上可以很好的分开。故认为强壮肉食螨与马六甲肉食螨是属于种内水平。从NJ、MP系统树看出,肉食螨属的三种肉食螨首先聚在一起,然后与触足螨属的鳞翅触足螨聚在一起,再与真扇毛螨属的中华真扇毛螨聚在一起。基于12S rRNA基因构建的系统树显示肉食螨科3属间关系为：(肉食螨属+触足螨属)+真扇毛螨属。 【英文摘要】This dissertation deals with the phylogenetic relationships among 5 species of 3 genera of cheyletids (Cheyletus malaccensis, Cheyletus fortis, Cheyletus aversor, Cheletomorpha lepidopterorum and Eucheyletia sinensis) by using the mitochondrial COⅠgene and 12S rRNA gene. The main contents and results are as follows: 1 Systems analysis based on COⅠgene of five species of cheyletidsThe research of five species of cheyletids present obvious bias in base composition, A+T content is significantly higher than that of G+C. This phenomenon is also common in other invertebrates mitochondrial DNA sequences.The COⅠgene sequence of five species of cheyletids shows that:There are no insertion/deletion/ termination codons in nucleotide sites.