通用核型分析软件GeneralMicrocomputerSoftwareforKaryotypeAnalysis.pdfVIP

遗传 HEREDITAS(Beijing)17(5):31-331995 通 用 核 型 分 析 软 件① 刘 东 旭 华（西医科大学医学分子生物学研究室，成都610044) GeneralMicrocomputerSoftwareforKaryotypeAnalysis LiuDongxu (LaboratoryofMedicalMolecularBiology,WestChinaUniversityofMedicalSciences,Chengdu610044) 用传统方法进行核型分析，需要复杂的测量和计算，因此，一般的研究者只基于小样本5（-10个细胞）来研究核 型．然而，若要获得准确的核型，样本数应不低于30(t)，这样，就更增加了其工作量，而且很容易导致错误．目前， 国内外有一些染色体图像分析系统可以进行核型分析，但不仅其设备昂贵，而且效果尚不理想 2)‘．为此，我们从 1989年起便着手 通‘用核型分析软件”的研制．设计目标是：(1)通用性，可分析具任意染色体数目的物种；(2) 研究者的经验非常重要，因而必须是人机对话系统，使研究者在必要的时候能干预其分析过程；(3)常规分析工作 应尽可能自动化；(4）能给出大量信息．软件用BASIC语言编写，在IBM-PC微机及其兼容机上调试运行．最 后经过编译，可在DOS下独立运行．整个软件 1990年已成雏形，经过试用，不断改进，至今已具完备功能． l软 件 模 块 及 主 要 功 能 1.1数据输入、修改与储存模块 原始数据的输入方式有两种，一是利用DATA语句，二是根据运行时的提示 逐个输人．无论采用那种方式输人，均可屏幕显示或打印原始数据，以便核对．若发现有错，可利用其修改功能对 已输人的数据进行修改，确认正确后，原始数据存盘，以便日后再次分析时调用． 1.2自动配对模块 首先，根据原始数据计算相对长度、臂比等参量，然后根据相对长度、臂比和随体位置等参 量 自动快速地进行配对，并屏幕显示或打印初步配对结果． 1.3专家校正模块 研究者可根据已有的经验对初步配对结果进行调整，以便与实际情况相符。校正完毕，显示 和打印最后配对结果，并把结果存盘． 1.4可靠性分析模块 样本的选择也影响核型分析的准确性，因此，在分析核型输出结果之前，对相对长度或（绝 对长度）或臂比进行统计分析，从而判断样本对总休的代表性．分析结果存盘，并可显示或打印统计分析结果． 1.5核型分析结果输出与存储模块 该模块首先以表的形式输出核型分析的各项结果，包括染色体编号；染色体 相对长度、绝对长度及臂比的平均值、标准误、变异系数和变异范围；染色休类型按（Levan,A．等 1964标 准 （〕‘）；随体位置；核型公式；不对称系数按（＾rano,H.1983公式’（〕）；核型分类按（Stebbins,G.L.1971标准，（〕） 和染色体长度比．接着打印出核型图． 2使 用 方 法 简 介 在DOS下键人KARYOS命令，程序启动并即刻进人主菜单： ①本文承蒙刘柏林、傅继梁和李子先教授大力支持，特致谢忱！ 32 遗 传 HEREDITAS(Beijing)1995 17卷 1．Firsttimetokaryotype. 2.Performkaryotypeanalysisagain. 3.JustPRINTthefinalpairingresultsofeachcell. 4.JustPRINTthekaryotypeanalysistable., 5.PRINTkaryogram 6.DOSshell. 7.ExittoDOS. 8.Abouthelp. 9.END. 2.1首次运行时，选择 “1，按提示输人存放数据的文件名D（ATA.DOC)、二倍体染色体数N(2n=8)、用于核型 分析的细胞数目(3（0),照片放大倍数(1000)二接着开始输人每个细胞各条染色体的原始数据，包括随体位 i(SAT POSITION)、长