中国常见肿瘤的全基因组关联研究进展.pdfVIP

筮．．棠I卷 第37卷第1期_特约专稿 中国常见肿瘤的全基因组关联研究进展 李娇元①，缪小平 ，林东昕②什 ①华中科技大学 同济医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系，武汉 430030；②中国医学科学院中国协 和医科大学肿瘤医院肿瘤研究所病因及癌变研究室，癌发生及预防分子机理北京市重点实验室，北京 100730 摘要 肿瘤的遗传学病 因复杂 ，全面系统地了解遗传变异在肿瘤发生中的作用是一项艰巨任务。全基 因组关联研究 (genome—wideassociationstudy，GWAS)在全基因组水平探讨常见单核苷酸多态性与疾病或其他表型的关联 ，为了解 复杂性疾病的发病机制提供新策略。针对不同肿瘤的6WAS，验证了一些基于候选策略所发现的肿瘤相关变异 发现了一 系列新的肿瘤易感基因或染色体区域。主要介绍在中国人群中开展的肿瘤GWAS所取得的一些成果 并在此基础上阐述 GWAS为中国常见恶性肿瘤遗传病因学研究带来的机遇与挑战。 关键词 肿瘤 病因学 中国人群 全基因组关联研究 肿瘤的发生是多因素、多基 因参与 的多阶 计划 (HumanGenomeProject)、人类单倍型计 段过程。不同肿瘤之问存在发病机理、临床特征 划(HapMapProject)]、千人基因组计划 (1000 等多方面的异质性，对各种环境暴露因素的易感 Genomes)等的实施和高通量技术的进步推动了 性存在差异。但不可否认的是，遗传学因素在肿 肿瘤遗传学的发展，各种分子生物学技术的发明 瘤的发生发展中发挥着十分重要的作用。从遗传 和应用也使得肿瘤遗传病因研究 日新月异。针对 学角度来看，肿瘤是多基因作用的结果。随着人 肿瘤家系的连锁分析发现了如BRAcl、BRAC2 们对肿瘤遗传学认识的不断深入和各种组学技术 等少数高外显率的肿瘤易感基因，而基于候选策 的兴起与发展，传统的候选基因策略已经无法满 略的关联分析表明，大量低外显率的易感基因突 足深入研究肿瘤遗传病因的需求。基于 “常见疾 变对于散发性肿瘤的发生、发展及预后也发挥重 病一常见变异”假说的全基因组关联研究在全基 要作用。除了处于基因编码区的非同义突变，编 因组水平探讨常见变异与疾病之间的关联…，发 码区的同义突变以及非编码区域的各种变异也影 现了许多新的肿瘤相关基因和变异位点，为肿瘤 响肿瘤的易感性。这些研究结果使人们认识到： 遗传学研究提供了新的思路和启示。本文介绍在 单个基因上的变异对肿瘤等复杂疾病的作用是微 中国人群中进行的肿瘤全基因组关联研究现状， 效的，导致疾病的可能是多个常见变异累积作用 并在此基础上对中国现阶段的肿瘤遗传病因研究 的结果，即 “常见疾病一常见变异”假说。为了 进行总结与展望。 全面了解与肿瘤易感性相关的遗传变异，从全基 因组水平对与疾病关联的单核苷酸多态一~(single 1全基因组关联研究的背景 nucleotidepolymorphism，SNP)位点进行筛选和识 白20世纪90年代末 以来 ，人类基 因组 别的全基因组关联研究应运而生。自2005年美国 干通信作者，E—mail：miaoxp@163．corn 千千中国工程院院士，研究方 向：常见肿瘤发生及其遗传易感性的分子机制、分子流行病学、个体化医学等。