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利用SAGE库挖掘有功能的假设基因.pdf

第 卷第 期 扬州大学学报 农业与生命科学版 25 3 ( ) VOl. 25 NO. 3 年 月 JOurnal Of YangZhOu University (AgriCultural and ife SCienCe EditiOn ) 2004 9 Sep. 2004 利用SAGE 库挖掘有功能的假设基因 1 2 2 1 潘兴元 宁 文 李朝军 ChOi A M 南京师范大学 分子医学生物学实验室 江苏 南京 (1. 210097 9 2. DivisiOn Of PulmOnary Pittsburgh Univ Pennsylvania 15213 USA ) 摘 要 利用生物信息学方法 从人大动脉内皮细胞 低氧处理的基因表达的系列分析 库中 挖掘出许 : (~AECs) (SAGE ) 多与低氧反应相关的假设基因 共预测到 个有功能的假设基因 其表达产物大部分与信号传导和基因的表达调控相 O 369 关 选择了 个候选基因 验证其是否真正表达 其中 个为真基因 半定量 表明 这些基因表达水平 O 8 - 7 O - RT PCR RT PCR 的变化在低氧处理的人脐静脉内皮细胞 中得到验证 结果表明 库中包含丰富的假设基因资源 可以 (~UVECs) O : SAGE 用生物信息学方法从中鉴定与特定生理或病理过程相关的假设基因O 关键词 基因表达的系列分析 低氧 生物信息学 假设基因 : 9 9 9 中图分类号: G 343. 1 文献标识码: A 文章编号: 1671 4652(2004) 03 0029 04 Seeking of Functional hypothetical Genes f rom SAGE Library 1 2 2

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