卵巢癌肝转移灶高表达基因SFT2D1的生物信息学分析.pdfVIP

生物磁学 年 第 卷 第 期 !# # $ $H?BIJK3H1B !# L/ M # J M $ ·论著· 卵巢癌肝转移灶高表达基因!#$% 的生物信息学分析! 华中科技大学同济医学院附属同济医院肿瘤生物医学中心 （湖北 武汉 !### ） 朱 涛 吴明富 周金华 李红雨 徐 钢 卢运萍 马 丁 摘要 目的：研究肿瘤原发灶和转移灶的基因表达差异，并采用生物信息学方法对一条卵巢癌肝转移灶高表达基因!#$% 进 行初步分析。方法：分别将卵巢癌原发灶和肝转移灶组织标本 ’()* 用 +,- . /0#1 和 +,2 . /0#1 标记后与表达谱芯片杂交，通过 信号扫描、处理后获得两者的表达差异基因。并用生物信息学方法对一条无功能研究的新基因!#$% 进行初步分析，阐明了它的 基因结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、蛋白质功能域等信息。并对多物种中的相似性蛋白进行了系统进化 分析。结果：表达谱芯片发现了共$3$ 条差异表达基因。对新基因!#$% 的上述性质进行了有效的预测，基本明确了该基因编码 蛋白为一内质网跨膜蛋白，可能参与肿瘤转移相关蛋白的合成与加工。结论：表达谱芯片技术是一种研究肿瘤转移基因表达差异 的有效的高通量研究方法。通过生物信息学分析，表明新基因!#$% 是一个有肿瘤转移研究价值的新靶点。 关键词：表达谱芯片；卵巢癌；生物信息学；肿瘤转移 $%%’()*+,%-. +’+/0.%. ( 123$4 . . + 5%65/0 789)7..7: 67’7 %’ 579+,%- *7,+.,+.%. ( ;+)%+’ -+’-7) ! # $% ，’# ()*+ . , - ，!.# /)* . 0-% ，12 %3 4%*516 7)3+8 91:1%650 41*216 ，$*+; ) : )2%3 ，$*+; ) (1=)5%3 4331+1 ， ， ， ， -%0*+ #*)?16:)28 , @5)1*51 %*= $150*3+8 ’-0%*4-55-5 -A1) 40)*% ： （ ） ， $13=3 ?@A7-,%;7 #6 789:6;7 =7 /??7;7@:, 789;7AA7/ B7@7A C7D77@ 9;’E;, :7A6@ 1F E@/ ’7EAEAA 6? G’6; E@/ 97;?6;’ E@ @E: C6@?6;’EHA E@E:,AA 6@ E @6I7: B7@7 ，!#$%，D=H= A =B=:, 789;7AA7/ @ =79EH ’7EAEAA （ ） ： JK L B7,5:. #=7 ’()* 6? =7 AAG7A @ 1F E@/ JK D7;7 ;7A97HI7:, ’E;M7/ D= +,- . /0#1 E@/ +,2 . /0#1 E@/ =,C;/N7/ D= 789;7AA6@ 9;6?:7 ’H;6E;;E, ， E@/ =7 /??7;7@:, 789;7AA7/ B7@7A D7;7 6CE@7/ L O@E: C6@?6;’EHA E@E:,AA ， DEA 97;?6;’7/ 6@ E @6I7: B7@7 @E’7/ !#$% D=6G ?G@H6@E: ;7A7E;H=7A E 9;7A7@ L OA B7@7 A;GHG;7 B7@6’7 :