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利用生物信息学资源设计简并引物.pdf
V01.26
第26卷第2期 天津师范大学学报(自然科学版) NO.2
2006
2006年6月 of Normal ScienceEdition) Jan
JournalTianjin University(Natural
文章编号:1671-1114(2006)02—0026—04
利用生物信息学资源设计简并引物
王少峡,陈丽媛,张竞秋,王振英
(天津师范大学化学与生命科学学院,天津300074)
摘要:根据已知序列设计简并引物以分离基因家族内的其他新成员,是发现新基因的一条捷径.介绍
了利用生物信息学资源设计简并引物的各个步骤:利用在线服务滚动式搜索家族所有成员序列;对家
族成员序列进行多序列对比;确定合适的保守区域衍0用专业软件设计引物;并对引物进行修饰等.
关键词:生物信息学;简并引物;基因家族
中图分类号:Q_31 文献标识码:A
the PrimerswithBioinformaticsResource
DesigningDegenerate
WANGShao—xia,CHEN J
Li—yuan,ZHANGing—qiu,WANGZhen—ying
of andLife Normal
(CollegeChemistryScience,TianjinUniversity,Tianjin300074,China)
whichare tOknown to
Abstract:Usingdegenerateprimers designedaccording sequencesamplify
in tOfind of
newmembersa isa Dew
genefamilygoodway genes.Eachstepdesigningdegenerate
withthebioinformaticsresourceis introducedinthis forall
primers systemically paper:searching
membersofthe theon—lineservesofthe se—
sequence familycyclicallyby internet;doingmultiple
the conservative the with
quencesalignments;ascertainingappropriate region;designingprimers
the the andSOon.
professionalsoftwares;embellishingprimers
Keywords:bioinformatics;degenerateprimers;genefamily
近年来,以三大生物信息中心兴起为标志的生
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