利用生物信息学资源设计简并引物.pdfVIP

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利用生物信息学资源设计简并引物.pdf

V01.26 第26卷第2期 天津师范大学学报(自然科学版) NO.2 2006 2006年6月 of Normal ScienceEdition) Jan JournalTianjin University(Natural 文章编号:1671-1114(2006)02—0026—04 利用生物信息学资源设计简并引物 王少峡,陈丽媛,张竞秋,王振英 (天津师范大学化学与生命科学学院,天津300074) 摘要:根据已知序列设计简并引物以分离基因家族内的其他新成员,是发现新基因的一条捷径.介绍 了利用生物信息学资源设计简并引物的各个步骤:利用在线服务滚动式搜索家族所有成员序列;对家 族成员序列进行多序列对比;确定合适的保守区域衍0用专业软件设计引物;并对引物进行修饰等. 关键词:生物信息学;简并引物;基因家族 中图分类号:Q_31 文献标识码:A the PrimerswithBioinformaticsResource DesigningDegenerate WANGShao—xia,CHEN J Li—yuan,ZHANGing—qiu,WANGZhen—ying of andLife Normal (CollegeChemistryScience,TianjinUniversity,Tianjin300074,China) whichare tOknown to Abstract:Usingdegenerateprimers designedaccording sequencesamplify in tOfind of newmembersa isa Dew genefamilygoodway genes.Eachstepdesigningdegenerate withthebioinformaticsresourceis introducedinthis forall primers systemically paper:searching membersofthe theon—lineservesofthe se— sequence familycyclicallyby internet;doingmultiple the conservative the with quencesalignments;ascertainingappropriate region;designingprimers the the andSOon. professionalsoftwares;embellishingprimers Keywords:bioinformatics;degenerateprimers;genefamily 近年来,以三大生物信息中心兴起为标志的生

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