海洋细菌新资源的发掘和在海藻降解方面的初步应用.pdfVIP

海洋细菌新资源的发掘及在海藻降解方面的初步应用 杜宗军 陈冠军 1山东大学威海分校海洋学院 2山东大学微生物技术国家重点实验室 海洋环境中拟杆菌类群分布广泛，是海洋生态系统中高分子质量溶解有机质的主要利用者 和海洋环境中物质循环的重要成员，其丰度仅次于变形菌门细菌而居于第二位。但由于分离培养 手段的限制，已获得培养的海洋拟杆菌较少，使得该类群的生态地位及功能的相关研究难以开 展。海洋中存在大量尚未被培养和认识的这类拟杆菌类群微生物，在海洋环境的物质循环中起 着重要而不可或缺的作用，其生物学功能有待于进一步挖掘。而其生物学功能的探讨，则必须 建立在拥有充足的菌种资源之上。因此，探讨海洋环境拟杆菌的分离培养方法则是非常必要的。 础。 分离获得的海洋拟杆菌部分代表性菌株的特征： 1．拟杆菌G22类群该类群为拟杆菌门深度分支的海洋细菌，新科级别。目前这个类群 已分离到两株细菌，G22和G312。细菌G22的16S 中收录的和G22的16S rDNA同源性大于88％的序列目前全部都来自未培养菌株，可见细菌 022类群的分类地位十分特殊，是拟杆菌的一个重要分支。我们的主要贡献就在于我们已经获 得了该类群菌株的纯培养。 2．拟杆菌FH5类群该类群为拟杆菌门深度分支的海洋细菌，新科级别。该类群已获得3 离自鲨鱼腮样品。细菌FH5的16S rDNA序列收录号为JQ683778。系统发育分析的结果表明， 式菌株和FH5的16S rDNA序列相似性只有89．4％。细菌Marinifilumfragile本身处于拟杆菌的 深度分支，这个属的分类位置未定。本项研究中获得的菌株FH5和已报道的三个分类位置未定 级以上的更高级的分类单元，以完善拟杆菌的分类系统。 3．海洋拟杆菌SSl2类群为新属新种，拟杆菌门深度分支海洋细菌。细菌SSl2的16S rDNA序列收录号为JQ683776，这个菌株分离自鲨鱼腮样本，它代表了海洋拟杆菌的一个新属， 其16S fermentans模式菌株的相似性为 rDNA序列和已报道的同源性最高的物种Cytophaga 94．1％，和其他可培养细菌种类的相似性都小于90％，和本课题组分离的菌株HY2、HY3等相 这个物种的分类地位是错误的，它不应属于噬纤维菌纲，而应该属jr拟杆菌纲，但是其分类位 进行系统学研究，将Cytophagafermentans的分类学地位问题一并理清。 4．海洋拟杆菌HY2类群为新属新种，拟杆菌门深度分支海洋细菌。细菌HY2和HY3 的16S 鲨鱼腮样本)。这些菌株处于拟杆菌门深度分支，至少是新属级别。和这些菌株最相似的物种是 rDNA相似性为92％左右。将HY2类群的菌株和上面介绍的SSl2 Cytophaga励嗍entans，其16S 菌株，以及Cytophagafermentans的模式菌株一起进行系统学分析，可望建立一个拟杆菌的高 级分类单元。另外，这个类群的菌株从山东近海海洋沉积物的不同样品中都能分离得到，说明 它们分布广泛，在生态系统中可能承担了比较重要的角色。 通过本实验结果证明，海洋环境中有大量拟杆菌新类群，发展新的分离手段，是获得细菌 新资源的重要途径。本研究也说明我们设计的分离方法与策略，对于微生物新菌种的分离是有 明显成效的。 海藻特别是大型海藻由含有丰富的多糖类物质且不含木质素，因此被认为是第三代生物乙 醇生产的最适原料资源，但工业发酵菌株难以对其分解和转化利用，是商业化应用的主要限制 因素。本申请拟在前期研究工作的基础上，以自主分离到的具有高效降解海藻多糖能力的新海 洋细菌为研究对象，对其代表性的菌株HQM9Q、M42和几l进行完整的基因组测序和功能注 释，分析三菌株在基因组组成上的差异与海藻多糖降解与利用的功能基因组差异；通过体外蛋 白质组并结合基因表达差异分析，探讨该功能基因组的表达调控。以此深入阐明细菌对海藻多 糖降解的作用机制和遗传的多样性，并在研究中发掘新的、有效的海藻多糖降解酶。研究结果 ·16· 海洋微生物产生的含氮和卤代化合物 朱伟明*