生脉散血中移行成分分子靶标计算机系统生物学预测.pdfVIP

生脉散血中移行成分分子靶标计算机系统生物学预测.pdf

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·104· of and 201 1月 WorldJournal TradifionalW∞ternMedicine1,November 世界中西医结合杂志2011年1 Integrated 生脉散血中移行成分分子靶标的计算机系统 生物学预测 朱艳芳1朱伟2 【摘要】 目的应用计算机系统生物学方法预测生脉散的分子靶标,并阐明有效成分群的协同 作用机制。方法采用TCMGeneDIT数据库系统,文本挖掘人参、麦冬、五味子各自所能影响的基因 或蛋白质数据;收集生脉散中五味子醇甲、五味子醇乙、戈米辛D、五味子乙素、一五味子紊、20(S) Studio 2.5版完成 一人参皂苷Rh、人参皂苷Rk3等13种血中移行成分,采用Aceelrys公司Discovery 等分子相互作用数据库中收集与预测靶标有直接相互作用的蛋白质,进行综合分析。结果 已有的 实验发现五味子有9个血中移行成分,人参只有4个血中移行成分;人参与55个基因相关,五味子与 1个基因相关,没有基因与麦冬相关。人参的4种血中移行成分不但可直接作用于实验证实的靶标, 还能影响相关靶标发挥广泛的生物学效应。五味子的9种血中移行成分只能通过影响相关靶标而发 挥间接的治疗作用。结论本研究结果可为生脉散的后续研究提供有用的线索,促进生脉散的分子 作用机制研究,本研究策略可为中药复方的系统研究提供参考。 【关键词】 计算机系统生物学;生脉散;协同作用 the molecular ofShenmaisandecoction Exploringpotential targetproteins usingcomputersystemicbiology Zhu wei2 Yan—fan91.Zhu ofChinese Second ofClinicalMedi— Medicine,Guan孕hou510520;2.The (I.G岬houUniversity College of of cine Chinese GuangzhouUniversity medicine,Guangzhou510006) To the molecular ofShenmaisandecoction 【Abstract】Objectivepotential targetproteins by predict W88 Fortext usedtoretrieveassocia- computerbiologyapproaches,Methodsmining,TCMGeneDlT systems tion or information regardinggenesproteins,PanaxginsengC.A.Mey.,Ophiopogonjaponicus(L.f)Ker Schisandra onthechemicalstructureof13main ab- Gawl.and ehinensis(Turez.)Baili.Based compounds 80rbedintobloodafteroraladministrationofShenmaisan identificati

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