单核苷酸多态性的研究及应用.pdfVIP

维普资讯 · 424 。 临床与 实验病理 学杂志 JC／inE3-pPathol 2002Aug；18(4) 单核苷酸多态性的研究及应用 徐恩萍 综述 来茂德 审校 关键词 多态现象(遗传学)；核苷酸类 ；遗传标记 ；基因 接 的方法是检测候选基因中所有常见的功能性突变；问接的 中图分类号 R392．2 文献标识码 A 关联 分析是使用分布在编码区和非编码区的高密度的SNPs 文章编号 1001 7399(2002)04 0424 03 标记分析患者和对照 ，根据连锁不平衡分析特定的 SNP．~和 表型的关联_3’ 最近一些实验室提出这样 的假设 ：一些常 1 单核苷酸多态性 (SNPs) 见的突变可能导致 一些常见疾病 的遗传风险 如果这个假 单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism，SNPs) 设成立的话，我们就可以通过一个直接的方法来鉴定致病突 是指在基因组水平上由于单个核苷酸变异所引起的DNA序 变．首先在人群中建立一个广泛的常见基因突变 的 目录 ．然 列多态性 在含有3O亿个碱基 的人类基因组 中，估计平均 后结合临床表型来直接检查这些突变 这个方法的其中一 每1000个碱基出现 1个 SNP_1J。SNPs可分为编码区 SNPs 个益处就是使得关联分析 比连锁分析具有更强 的统计效 ． 力 …’、 (cSNPs)、基 因调控区 SNPs(pSNPs)和存在于连接两个基 因 一 之间的I)NA 中的随机非编码区的SN (rs )3类_3一 其 2．2 肿瘤的杂合性缺失研究 SNPs的高密度和遗传稳定 中最有意义的SNPs存在于基因的编码 区和基因调节域 ，它 性等特性使得它们适用于肿瘤的杂合性缺失研究 It。等 们能够导致基 因功能改变 ，对表型产生很 大的影 响_2’引 并 在 hMLHI基因的启动子区域发现 了 93G—A多态性 ．并且 有研究报道那些能够使基因功能丧失 ，导致死亡 的SNPs在 在PCR—RFLP分析此多态性时检测到了杂合性丢失一由于 人群中将随着年龄增长而降低 ¨j G／A杂合子的出现频率高达 5O％．且 易被 PCR—RFIP检测 在遗传学分析中，SNPs已成为继 限制性酶切 片段长度 到 因此 ，这个多态性就成 了检测 hMLH1基因等位基因丢 多态性 (restrictionfragmentlengthDolymorphism，RFLP)和微 失的最有用的标记之一 卫星之后的第三代DNA遗传标记 因其较前两者分布更广 2．3 疾病遗传机制的阐明 SNPs作为 人类最 常见的遗 传 泛。密度更高 ，有可能在密度上达到人类基 因组 “多态”位点 变异类型，将会为人类遗传学研究提供强有力的工具．尤其 数 目的极 限 ．并且 SNPs与 RFLP和微卫星等 DNA标记不 是编码 区和调控区的 SNPs能够导致功能性改变 ，对表型产 同，不再以 “长度”的差异作为检测手段 ，而是直接序列的变 生很大的影响 ，可以被用来阐明疾病的遗传机制 异作为标记 ．这样更易于进行 自动化分析。 2．3．1 SNPs和部分肿瘤易感性 的关系 许多研究 已证明