16srRNA序列同源性分析和细菌系统分类鉴定.pdfVIP

·12 · 国外医学卫生学分册 004　16s rRN A 序列同源性分析与细菌系统分类鉴定 中国预防医学科学院营养与食品卫生研究所　(北京　100050) 焦振泉　刘秀梅综述　孟昭赫审校 　　摘要　本文介绍了 16s rRN A 序列测定及同源性分析的方法, 并阐述了其在细菌系统分类鉴 定中的重要作用。 　　关键词　16s rRN A 　序列同源性分析　细菌　分类鉴定 　　近 10 多年来, 随着分子生物学理论和技 16 s rRN A 为原核生物核糖体中一种核糖 术的迅速发展, 特别是作为生物技术里程碑 体RN A 。目前, 在细菌的系统分类学研究中最 的聚合酶链反应(PCR ) 技术的出现及核酸测 有用的和最常用的分子钟是 rRN A , 其种类少, ( ) 序技术的不断完善, 产生了许多新的分类方 含量大 约占细菌RN A 含量的80% , 分子大 法, 如: 质粒图谱、限制性片段长度多态性分 小适中, 存在于所有的生物中, 特别是其进化具 析、脉冲场凝胶电泳、 指纹图、 指 有良好的时钟性质, 在结构与功能上具有高度 PCR rDN A 纹图、16 s rRN A 序列分析等。它们主要是对 的保守性, 素有“细菌化石”之称。 细菌染色体进行直接的DN A 分析或对染色 rRN A 在大多数原核生物中都具有多个 [ 1 ] 体外的 片段进行分析, 从遗传进化的 拷 贝 , 5 、16 和 23 的拷 贝数相 DN A s s s rRN A 角度去认识细菌, 从分子水平进行分类与鉴 [2 ] 同 , 16 s rRN A 由于大小适中, 约 15kb 左 定, 使细菌的分类越来越科学和精确, 特别是 右, 既能体现不同菌属之间的差异, 又能利用 16 s rRN A 序列分析方法的出现使细菌进化 测序技术来较容易地得到其序列, 故被细菌 可以通过试验研究来证实。这是细菌分类史 [3 ] 学家及分类学家所接受 。所以, “细菌系统 上的一次革命, 必将使人们对生物进化及其 学研究特设委员会”建议依据系统发育关系 与其它生物学科关系的认识更加深入。 分类。通过对其序列的分析, 可以判定不同菌 属、菌种 间遗传关系 的远近。细菌 的 16 s 1　16 的结构与性质 [4 ] s rRNA rRN A 的可变区位点结构如下 : 　　 　可变区( , 1～ 10) 　　 1: 6 1～ 106 　　　 2: 12 1～ 240 var iab le