FtsZ蛋白同源性分析在乳酸菌系统学研究中应用.pdfVIP

卷 期 ! 微 生 物 学 报 ’( )! 0’ ) 年 月 #$$ %$ !#$ %’()(*(+$ ,-$ *+,’-./ #$$ !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! !#$ 蛋白同源性分析在乳酸菌系统学研究中的应用 张 斌 东秀珠 （中国科学院微生物研究所 北京 %$$$=$ ） 摘 要： 是一种广泛存在于细菌和古菌中的结构保守的蛋白质，在细胞分裂的过程中起关键的作用。通过 :,GM N4O 扩增 基因的一段 的核苷酸，构建了干酪乳杆菌 片球菌及相关乳酸菌的 蛋白系统发育树。将此系统 :,GM =$$-P 6 :,GM 树和%3 /Q0R 系统树比较发现二者的拓扑结构非常相似。在两个基因系统树中，片球菌与乳杆菌的种均显示了较 近的亲缘关系，而与其它球状的乳酸菌，如链球菌和肠球菌的亲缘关系较远。研究还表明:,GM 蛋白序列的分辨率 高于%3 /Q0R，更适用于乳酸菌种间的系统分类研究。 关键词：乳杆菌，片球菌， ，系统发育分析 :,GM 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） SI1I R $$$%6#$I #$$ $6$%6$! 乳酸菌是一类能利用可发酵糖产生大量乳酸的 % 材料和方法 革兰氏阳性细菌，除双歧杆菌外，都属于低T4 革兰 ［］ % 氏阳性细菌分支 。乳酸菌是一群非常异源的细 % % 主要试剂和仪器 菌，其细胞形状有杆状和球状；其乳酸代谢类型既有 聚合酶、 质粒、 连接酶、 Q0R PU4@68 8! Q0R ［］ 同型发酵，又有异型发酵和兼性异性发酵# 。 Q0R 凝胶回收试剂盒均购自上海申能博彩生物科 乳酸菌自发现以来，各属的分类地位一直变化 技有限公司。其它试剂均为分析纯。N4O 仪为 不定。自 同源性分析应用于细菌分类学 （ %3 /O0R 8K./@’(LC. R@P(A,/’C ! V;/CG,.;B 8K./@’(LC. 4’/P’6 以来，乳酸菌各属间的亲缘关系也被进一步阐明。 /;,A’C ）。 虽然%3 /O0R 被公认为是用于系统学研究的最理 %’ 菌株和培养条件 想的生物大分子，但在一些细菌类群的分类中也存 片球菌的模式菌株均来自德