DNA条形码技术在植物中第研究现状_闫化学.pdfVIP

植物学报 Chinese Bulletin of Botany 2010, 45 (1): 102–108, doi: 10.3969/j.issn.1674-3466.2010.01.015 ·专题论坛 · DNA条形码技术在植物中的研究现状 * 闫化学, 于杰 西南大学园艺园林学院, 重庆 400716 摘要 DNA条形码技术(DNA barcoding)是用短的DNA片段对物种进行识别和鉴定的分子生物学技术。在动物研究中该技 术已经成功应用于利用线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(COI)进行物种鉴定和发现隐种或新物种。相对于动物, COI基因在高 等植物中进化速率较慢, 因此植物条形码研究以叶绿体基因组作为重点, 但目前还处于寻找合适的基因片段阶段。许多学 者对此进行了积极的探索, 报道了多种植物条形码的候选片段或组合, 但还没有获得满足所有标准的特征位点片段。该文 介绍了DNA条形码的标准、优点、工作流程及数据分析方法, 总结了DNA条形码在植物中的研究现状。 关键词 COI基因, DNA条形码, 植物 闫化学, 于杰 (2010). DNA条形码技术在植物中的研究现状. 植物学报 45, 102–108. 自卡尔·林奈对生物物种进行系统分类以来, 生 进展综述如下。 物学家利用各种各样的性状——颜色、外形和行为等 来鉴定动物和植物。最近数十年, 研究者开始利用 1 DNA条形码的标准及优点 DNA中携带的遗传信息来完成这个任务。DNA条形码 理论上, DNA条形码利用A 、T、C和G 4个碱基, 只需 (DNA barcoding)技术是一种利用短的DNA片段对物 要15个碱基位点就可以得到415个排列方式, 远大于 种进行识别和鉴定的新的分子生物学技术, 是生物学 现存物种的数量( 肖金花等, 2004) 。Meyer 和 近期研究的热点之一。2003年, 加拿大圭尔夫大学 Paulay(2005)根据每百万年2% 的物种进化速率, 推 (University of Guelph) Paul Hebert教授提出了“DNA 测对于一个有1百万年生殖隔离历史的物种类群, 一 条形码”概念, 将条形码技术引入生物界。其思想产生 段长度为600 bp 的DNA序列平均就有12个特征信号 于现代商品零售业的条形编码系统, 就像以超市条形 位点可用于识别, 即可以包括所有物种。即使在亲缘 码识别产品一样, 利用A 、T 、C和G 4个碱基在基因 关系很近的类群中, 大多数物种的进化历史都超过了 中的排列顺序识别物种。Paul Hebert教授率先于 1百万年, 所以600 bp的DNA片段足够分析当前绝大 2003 年选取线粒体细胞色素c 氧化酶亚基 I 多数的物种。 (cytochrome c oxidase subunit 1, COI)作为动物中 Kress等(2005)和Taberlet 等(2007)提出了理想 通用的物种鉴定标记(Hebert et al., 2003a, 2003b), 的DNA条形码标准, 综合起来有以下几点: (1)具有可 并提出DNA条形码的定义: 通过使用短的标准DNA 以区分物种的足够变异和分化, 同时种内变异必须足 片段, 对物种进行快速、准确的识别和鉴定。目前, 够小; (2)有高度保守的引物设计区以便于设计通用引 DNA条形码技术在很多动物分类群中得到了成功应 物; (3)片段足够短, 以便于DNA提取和PCR扩增, 尤 用(Hebert et al., 2004a, 2004b; Ward et al., 2005; 其是