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p53蛋白的序列、结构 和功能分析 生信2班C队 主讲：黄律 组员：邓绪芳 张荣 高晓 陈兆国 黄律 张国恩 谭菲菲 黄雷 刘长龙 张瑞杰 赵兴旺 •一、概述（结构和功能） •二、一级结构性状分析 •三、二级结构特性分析 •四、三级、四级结构性状分析 •五、结构突变 将要使用的生物信息工具 • 一级结构 PEPSTATS， PEPINFO，MEGA， Clustalx • 二级结构 CDD， MEME，webLOGO， SMART， PREDATOR,SPDBV • 三级结构 SPDBV 一、 p53蛋白概述 1、结构 p53定位于人类17p13.1染色体上，全长约16-20 kb,由11个外显子和10个内含子组成，其编码产生是 393个氨基酸组成，是与核DNA结合的磷蛋白。p53基 因的一级结构已基本清楚，含有三个结构区：（1） N 端 酸 性 区 (1～75 位氯基酸) ；（2）中间疏 水区(75~l50 位氨基酸／ 鼠，80~l5O 位氨基 酸／ 人)；（3）C 端碱性区分布于276~390 位 (鼠)或3 l 9 ~3 9 3 位 (人)氨基酸之间。其中部 区能直接与DNA结合，绝大多数肿瘤中检查到的p53 点突变即发生在该区域中。 2、功能 （1）、当我们的细胞受到外部环境的影响时，关 键的细胞调节因子受到损害，细胞就会进入无限制 的生长，产生肿瘤。这时候， p53就发挥作用，抑 制肿瘤。 （2）一般情况下p53的量很低，但当DNA受到损 伤时， p53的量增加，启动保护性程序，致使细胞 的程序性死亡，凋亡或者让细胞自杀，以此去除损 伤。 （3）此外还通过细胞外和细胞内途径促进细胞凋 亡，调控细胞周期。 p53细胞凋亡机制 二、一级结构性状分析 1、用 PEPINFO 分析人 p53蛋 白的氨 基酸种 类特性 • N端为高电荷区，富含大量的酸性氨基 酸，易形成α螺旋。 • 中间疏水区，主要都是中性氨基酸。 • C端富含大量的碱性氨基酸，易形成α 螺旋。 2、13种动物的p53蛋白分析 动物种类 蛋白序列号 蛋白长度 P04637_HUMAN 人 P04637 393 P02340_MOUSE 小鼠 P02340 390 Q9TUB2 _pig 猪 Q9TUB2 386 P10360 _chick 鸡 P10360 367 P10361_RAT 大鼠 P10360 391 P13481_green 绿猴 P13481 393 monkey P41685_cat 猫 P41685 386 P51664_SHEEP 绵羊 P51664 382 P67939_BOVIN 牛 P67939 386 Q9WUR6_Guinea pig 豚鼠 Q9WUR6 391 Q29537_DOG