大壁虎线粒体基因组全序列与其结构(英文).pdfVIP

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2017-08-07 发布于安徽
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大壁虎线粒体基因组全序列与其结构(英文).pdf

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维普资讯动物学研究 2005。Apr．26(2)：123—128 CN53-·1040／Q ISSN0254-·5853 ZoologicalResearch CompleteSequenceandGeneOrganizationofthe MitochondrialGenomeofTokay(Gekkogecko) HAN De—rain1一．ZHOU Kai—ya1， r1．JiangsuKeyLaboratoryforBioresourceTechnology，Collegeof Sciences，Ⅳd耐ngNormalUniversity，Na ng 210097，China； 2．SchoolofUfeSciergce，AnhuiUniverstiy，Hefei230039，Chn／aJ Abstract：Long—PCR amplification，cloneandprimer-walkingsequencingmethodswereemployedindeterminethe completesequenceofmitochondrialgenomeoftokay(Gekkogecko)．Thegenomeis16435bpinsize，contains13pro— tein—coding，2ribosomal nad22transferRNAgenes．ThemtgenomeofGekko issimilartomostofhtevertebratesingene components，order，orientation，tRNA structures，low percentageofguaninena dhighpercentageofhtymine，na dskewsof baseGCnadAT．BaseAwas preferredathtirdcodonpositionsforproteingenesissimilra toma phibiansnadfishesrahter thanamnionvertebrates．Thestandardstopcodes(TAA)presentonlyinthreeproteingenes，lesshtna htoseofmostver- tebrates．TrnasferRNAgenesrangeinlengthfrom63to76nt，hteirplanrastructurepresentcharacteristiccloverleaf，ex- ceptfortRNA—CysandtRNA—Ser(AGY)becauseoflackinghteDarm． Keywords：Gekko gecko ；Squma ate；Completesequenceofmitochondrialgenome；Geneorganization 大壁虎线粒体基因组全序列及其结构韩德民一，周开亚， (1．南京师范大学生命科学学院生物资源技术江苏省重点实验室，江苏南京 210097；2．安徽大学生命科学学院，安徽合肥 230039) 摘要：采用长PCR扩增、克隆和引物步行等方法，测定了大壁虎(Gekkogecko)线粒体基因组全序列。序列全长 16435bp，共有 13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和22个 tRNA基因。基因组的组成、顺序、编码链的选择、tRNA的结构、较低的碱基G含量、对碱基T的偏好以及GC和AT偏斜，都与大部分脊椎动物相同或相近。但有些特征揭示了壁虎类的原始性：蛋白质编码基因密码子第 3位表现为对碱基A的偏好，更接近两栖类和鱼类而不是羊膜动物；标准终止密码子(TAA)只出现于3个蛋白质编码基因中，比大部分脊椎动物少。tRNA 基因核苷酸长度为63