核开关结构、机制和应用新进展.pdfVIP

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 2010, 37(1): 7~ 13 核开关结构、机制及应用新进展 何珊 来鲁华* (北京大学化学与分子工程学院，北京100871) 摘要 核开关(riboswitch)是Breaker 等在2002 年发现的一种全新的转录后调节机制 它可以通过小分子与mRNA 结合来直 接调控基因的表达，不需要任何蛋白质的参与 与常见的经由蛋白质的调控方式相比，riboswitch 响应更迅速，对细胞内代 谢物的变化更敏感 它的发现为RNA 研究展示了新的领域 目前在这个领域，既有基础研究， riboswitch 晶体结构解析、 作用机制和动力学研究，又有前沿应用研究， 基于riboswitch 的生物传感器和药物设计 Topp 等通过设计riboswitch 成功 地改变了大肠杆菌的趋化性，这为合成生物学和人工生物网络的设计提供了新思路 目前对于riboswitch 结构、机制及动力 学的研究为基于riboswitch 的合理药物设计奠定了基础，有望针对这一新的机制开发新一代抗菌药物 关键词 核开关(riboswitch) ，基因调控，药物设计，合成生物学 学科分类号 Q756 DOI: 10.3724/SP.J.1206.2009.003 15 自20 世纪80 年代起，随着核酶和RNA 干扰 素B1 或其焦磷酸盐衍生物而不需要蛋白辅酶的参 的发现，RNA 分子研究变得炙手可热 然而它给 与 这个mRNA 是编码维生素B1 生物合成相关酶 科学家们带来的惊喜显然还远未结束，另一种能够 的，这样大肠杆菌就可以通过感受TPP 含量来调 结合到mRNA 的某个区域从而实现直接调节基因 节维生素B1 的生物合成 表达的转录后调节机制已经被发现 它是在2002 自2002 年确定了第一个riboswitch 以来，通 年由Breaker 领导的研究小组发现的，被命名为 [3] 过各种方法，特别是生物信息学的方法 已经发 [1] [2] “riboswitch ” 跃磊等 将其译为 “核开关”，并 现了很多种类的riboswitch 表 1 总结了部分 在2004 年对其结构特点和作用机制做了介绍 riboswitch 的名称、调节小分子和功能 近几年来，这个领域有了很大进展 本文主要 1 2 Riboswitch 的主要调节机制 介绍最近解出的riboswitch 三维结构和一些特殊的 Riboswitch 可以位于mRNA 的5 端非翻译区 调控机制与动力学研究，基于riboswitch 的生物传 (untranslated region, UTR) ，也可以位于前体mRNA [4] 感器的成功设计和抗菌药物的研发近况，并对该领 的3 UTR 和内含子区域 其结构分为两个关键 域未来可能的发展方向作了展望 功能域：适配子和表达模块 适配子直接结合小分 子，表达模块根据适配子结合小分子与否变化构 1 Riboswitch 的组成和调节机制 象，从而调节基因的表达 多数的表达平台响应小 1 1 Riboswitch 的组成 分子结合后会抑制基因的表达，但也有一些是启