尖吻蝮毒液类凝血酶的克隆和序列分析.pdfVIP

尖吻蝮毒液类凝血酶的克隆和序列分析.pdf

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24 5 Vol124 N o15 2007 10 JOURNAL OF BIOLOGY O ct, 2007 1 1 2 , , ( 11安徽大学生命科学学院 安徽省生态工程与生物技术重点实验室, 合肥 230039; 21 中国科学技术大学生命科学学院, 合肥 230026) : 以类凝血酶的 RT- PCR 物为模板, PCR 扩增出其 cDNA 片断克隆尖吻蝮的毒液类凝血酶 cDNA, 分析其 密码子运用的特点用软件进行多序列比对并分析克隆出多 个尖吻蝮毒液类凝血酶的 cDNA, 得到其基因密码 子运用的有关数据结果表明尖吻蝮毒液类凝血酶同时存在着保守性与多样性, 有着较明显的密码子偏好性, 在 进化中承受了碱基组成和自然选择的压力 : 类凝血酶; 碱基组成; 自然选择; 密码子偏好性 : Q754, Q785 : A : 1008- 9632( 2007) 05- 0020- 05 (Thrombi - like e zym e, TLE ) 11212 ( Relative sy o ym ous codo [ 1] , usage, RSCU ), A B, , : , , RSCU = X i / Xavr XIII, , X i i , , , Xavr , [ 5] [ 2] GC, GC GC3S , GC [ 3] [ 6] , ( Effective umber of codo s, Nc) , , Nc 20( 20 20 9 ) ~ 61( , , ) NC- GC3S, 1 , 111 RT - PCR [ 6] : DH5A, pMD18- T T aKa- 29 N C = 2

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