基因表达系列分析与其在心血管系统中的应用.pdfVIP

心血管病学进展 2004 年增刊 ·59 · 基因表达系列分析及其在心血管系统中的应用 蒋跃绒 　综述 　殷惠军 　陈可冀 　审校 ( 中国中医研究院西苑医院心血管病研究室 , 　北京 　100091) Serial Analysis of Gene Expression and Its Application in Cardiovascular Diseases JIANG Yuerong , 　YIN Huijun , 　CHEN Keji ( Depart ment of Cardiovascular Diseases , Xiyuan Hospital , China Academy of T raditional Chinese Medcine , 　Beijin g 　100091, 　Chi ) na 文章编号 (2004) 增刊005904 　　　　　中图分类号 :Q786 ;Q322. 1 　　　　　文献标识码 :A ( ) 　　摘要 : 　基因表达系列分析 SA GE 是近年发展起来的用于大规模研究基因表达的新方法 ,具有发现新基因及基因表达定量分 析的功能。其主要优点是不需事先知道基因序列且能提供组织或细胞中每一个转录本的定性和定量信息 ,对低丰度转录本敏感并 可发现新的转录本。同时 ,SA GE 数据库的电子特性又可允许不同研究者构建的文库之间直接进行比较。本文对 SA GE 技术的演 进及其近年来在心血管系统疾病研究中的应用作一总结。 关键词 : 　基因表达系列分析 ;心血管系统 　　人类基因组物理图谱仅代表遗传复杂性的一个层 的oligo (dT) 引物合成双链cDNA ; (3) cDNA 用锚定酶 面 ,另一个更为重要的层面是这些基因在有机体内的 (如 Nla Ⅲ,识别位点为 CA TG) 消化以产生 3 ’粘端; 时空表达[1 ] 。高通量基因表达技术所提供的大量基 ( ) ( ptavidin 4 3 ’cDNA 片段与链霉亲和素蛋白磁珠 stre 因表达信息 ,有利于阐明各种复杂疾病如心血管系统 coated beads) 结合 ; ( 5) 将 cDNA 均分成两份 ,分别连 ( ) ( 疾病的病理进程。 接接头 linker A 或B ,接头包含标签酶 如 BsmF1 ,为 ( ) ( ) 基因表达系列分析 serial analysis of gene expres Ⅱ型限制性内切核酸酶 识别位点 ; 6 标签酶切割识 sion , SA GE) 是 1995 年由约翰·霍普金斯大学 Vel 别位点下游的 14bp 的 DNA , 并将带有接头序列的 culescue 等[2 ] 发展起来的用于大规模研究基因表达的 cDNA单标签从磁珠上释放 ; (7) 用 klenow 片段补平释 新方法 ,具有发现新基因及基因表达定量分析的功能。 放的单标签末端 ; (8) 用连接酶将单标签首尾连接形成 (