生物信息学-07基因组分析.pdf

第七章 基因组分析 一．什么是基因组 (genome)? 一．什么是基因组 (genome)? 二．基因组分析及数据库建立路线 二．基因组分析及数据库建立路线 三．原核生物基因组的特征及其分析 三．原核生物基因组的特征及其分析 四．真核生物基因组的特征及其分析 四．真核生物基因组的特征及其分析 五．功能基因组学 五．功能基因组学 六．比较基因组学 六．比较基因组学 第一节 什么是基因组 (genome)? 第一节 什么是基因组 (genome)? 基因组（genome ）是指包含在一种生物的DNA（部分病毒是 基因组（genome ） RNA）中的全部遗传信息。 绝大部分基因组，包括所有的细胞生命形式的基因组，是 由DNA组成；一些病毒具有RNA基因组; 真核生物：指一个物种的单倍体染色体所含有的一整套基 真核生物 因和非编码DNA； 原核生物：一般只有一个环状DNA分子，其上所有的基因 原核生物 和非编码DNA为一个基因组； 真核生物细胞中的细胞器(如叶绿体、线粒体等) 中的DNA 也为环状，构成叶绿体基因组、线粒体基因组。 基因组的大小用碱基对(base pair ，bp) 的数量来表示：103 6 为kb ，10 为Mb。 基因组大小与物种 基因组大小与物种 的关系 的关系 基因组的大小大致上与物种 进化的复杂性相关； 大多数真核生物的基因组都 比原核生物的基因组大，比原核 生物的基因组复杂； 随着动物或植物进化程度的 上升，每个单倍体的DNA含量 一般趋于增加，但是存在例外 （C值佯谬）； 思考：为什么会出现“C值佯 谬”？ 基因组大小(kb) 基因组 基因组大小(kb) 型式 基因组 型式 病毒 病毒 MS 4 单链RNA 不 4 单链RNA 不 SV40 5 环状双链DNA SV40 5 环状双链DNA 同 同 ΦX174 5 环状单链DNA ΦX174 5 环状单链DNA SARS-CoV 30 单链RNA 生 SARS-CoV 30 单链RNA 生 152 单纯疱疹病毒 152 物 单纯疱疹病毒 物 T2、T4、T6 165 线性双链DNA T2、T4、T6 165 线性双链DNA 基 基 267 天花