N-甲基吡咯类聚酰胺的合成及其与DNA的相互作用.pdfVIP

维普资讯 Vo1．26 高等 学校 化 学 学报 No．12 2005年 l2月 CHEMICALJOURNALOFCHINESEUNIVERSITIES 2267～2269 [研究简报] Ⅳ-甲基吡咯类聚酰胺的合成 及其与DNA的相互作用 李钦玲 ，周 江 ，刘 丹 ，袁 谷 (1．北京大学化学学院化学生物学系生物有机与分子工程教育部重点实验室，北京 100871； 2．青海民族学院化学系，西宁 810007) 关键词 聚酰胺；电喷雾离子化质谱；DNA识别 中图分类号 0627．7 文献标识码 A 文章编号 0251-0790(2005)12-2267-03 含有Ⅳ-甲基吡咯(P)r)和Ⅳ-甲基咪唑(Im)的寡聚酰胺是一种人工合成的小分子，它能够在小沟中 与DNA的特定序列进行识别，并具有穿透细胞膜，调控基因表达的功能，是一类重要的生理活性物 质 ¨-4]．Dervan等 发现寡聚酰胺分子主要是通过反平行成对的N-甲基吡咯和N-甲基咪唑的氨基酸 残基与DNA的碱基作用而对 DNA进行识别的，其Py／P)r配对识别A ·T或T ·A碱基对，而Py／Im和 Im／Py配对分别识别C ·G和G ·C碱基对 ．寡聚酰胺分子中通常还含有卢-氨基丙酸 (卢)、-氨基丁 酸()和Ⅳ，Ⅳ．二甲基氨基丙胺(Dp)．．氨基丙酸和 ．氨基丁酸的作用主要是增加分子的柔性，调节寡 聚酰胺分子和DNA结合时的曲率，提高寡聚酰胺分子对DNA的亲和力 ．Ⅳ，Ⅳ-二甲基氨基丙胺则增 大寡聚酰胺分子的水溶性，它对寡聚酰胺分子识别 DNA时的取向以及细胞膜的穿透具有重要意义． 本研究主要是设计并合成 了 3个含有 4个 Ⅳ-甲基 吡咯 的聚酰胺化合物 (PyPyPyPyflDp， PyPyPyPyTDp，NO2PyPyPyPyflDp)，并使用ESI-MS法研究了其与DNA的相互作用． 1 实验部分 1．1 试剂和仪器 N．甲基吡咯(Py)，HOBT，DCC，．氨基丙酸(卢)， ．氨基丁酸()和Ⅳ，Ⅳ-二甲基氨 基丙胺 (Dp)均购 自Acros公司，钯碳购 自Aldrich公司．TLC薄层板用的GF 硅胶及柱层析用的 ZCX．11型硅胶均购 自青岛海洋化工厂．其它试剂均为国内市售．Ⅳ，Ⅳ-二甲基甲酰胺 (DMF)和四氢呋 喃(THF)用前需作无水处理．VarianHY200MHz和 300MHz核磁共振仪 (TMS为内标，CDC13或 DMSO．d6作溶剂)；ThermoFinniganLCQDecaXPPlus质谱仪． 1．2 化合物的合成 用卤仿反应 和 DCC／HOBT偶联反应 合成 PyPyCOOMe，NO2PyPyCOOMe， NO2PyPyflCOOEt及NO2PyPyTCOOEt等中间体，然后合成3个聚酰胺——PyPyPyPyflDp，PyPyPyPyyDp 和 NO2PyPyPyPyflDp．结构式如 Scheme1所示． 取 0．74 g PyPyCOOH (3 NH mmo1)，将其置于6mLDMF中 0 O I NH 、1rNH＼／，＼／N＼ 使之全溶，分别向溶液中加入 O 0．41g(3mmo1)HOBT和0．62g Scheme1 Thestructuresofpolyamides1，2and3 (3mmo1)DCC，于室温搅拌过 1：X：H，几：1；2：X：H，凡：2；3：X：NO2，几：1． 夜．另取 1．18gNO2PyPyflCOOEt(3mmo1)溶于7mLDMF中，加入0．20gPd-C，于常压氢化20h．除 去钯碳，将滤液加入活化酯反应液中，搅拌 12