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F4 吲哚振动基频的计算和归属
鄢国森徐学军谢代前薛英
(四川大学化学系,成都6l0064)
吲哚为色氨酸分子的特征侧链,色氦酸分子和吲哚的其它衍生物的许多眭质取决于吲
哚分子。由实验和计算得出准确的町f哚分子的特征光谱是研究和解释蛋白质实验的基础。
由于c。llier[】23所得谱线为气相光谱,不存在溶剂效应;并且,所得谱线较完整,本文计
算得频率预测值仅与其作误差比较。
1计算方法
和B3Ps6,6—3lG”)对吲躁分子的电子基态的结构参数、力常数、振动基频、红外振动强度
等进行了计算。对计算结果与实验结果进行比较,发现BLYP,’6—3lG”谐力场所给出的振动
基频的结果与CoUier实验测定的气相吲哚分子的振动谱线吻台得较好。通过对BLYP/6—
31G”计算结果的简正坐标分析,得出了振动基频的势能分布,并对吲噪分子振动基颁的对
称性及振动模式的归属进行了部分调整,给出了明确的瑚面外摆动的频率的指认。
2.计算结果和讨论
吲哚分子为平面结构,属于C。点群,吲哚分子托q2振动基频,其中29个平面内振动
DFT方法计算的非标
模式为A’不可约表示,13个面外振动基频为A”不可约表示。本文Hj
4
发频率见表1,与实验基频的绝对值平均误差分别为40j、16.3、45.1利26cm。:其
1。依据BLYP,76—3lG”的计算力场结果对吲哚分子进行筒正坐标分忻并得出势能分布(见袭
1)。吲哚分子谱线~般性的对称性和振动模式的归属见表1:我们主要讨论州面外摆动的
enL。:』=14
归属于ⅥI面外摆动,可见,Ⅷ面外摆动的基频指认{}常混乱。jValdDFT计算结果
403cml至437
将Ⅻ面外摆动限定r cm:范Ⅲ。本文的sVwN,6—31G”计算频率经简正坐标
cm“归属丁Ⅻ面外摆动。
分}斤得出PEDs,将4j9
379
B3P哟l/6一
刁i可约 实验值 BLYP/6一 振动 sV霄N/6一 B3LYP/6一 势髂分币
垂蚕 i!!: 塑蕉 §!芝 i!£ §!曼==
A 3524.5 3577.3 44i5 3806.6 3689,2 3724.8 99“,
3140 3192.7 6.82 32“3 3273.7 3285.666(2).33(3)
3119 3173.1 2.42 3193.0 3254.O 3265.966(3),33(2)
3∞O 3120.2 28.76 3142O 3204.0 3216.542(6),37(5)
3130 3205.2
3072 3107.8 43,38 6 3192.2 32(4).20(6)
3061 30972 3.70 31202 3181.6 3194.7 42(7),36(4)
3051 309l,3 3.15 3115.2 3175.2 3187.9 37(5),26(7)
1625 1609.9 2.∞ 16756 16749 1687.724(16),15(13)
1.37 1624 1632l 16436
1576.5 1568.7 8
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