杨树SSR标记在柳树中通用性分析.pdfVIP

分子植物育种，2008 年，第6 卷，第6 期，第1134-1138 页 Molecular Plant Breeding, 2008, Vol.6, No.6, 1134-1138 研究报告 Research Report 杨树SSR 标记在柳树中的通用性分析 * 杨彦伶 张亚东 张新叶 湖北省林业科学研究院, 武汉, 430079 * 通讯作者, yangyanling999@ 摘 要 简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)分子标记因其具有稳定性好、多等位基因、共显性遗传、 数量丰富、基因组覆盖性好等优点，现已广泛应用于多种植物的遗传育种研究中。本研究利用杨树的48 对 基因组SSR 引物及48 对EST-SSR 引物对6 个苏柳品种进行了通用性分析。结果表明，杨树EST-SSR 引物 在柳树中的通用性达54.2% ，而基因组SSR 的通用性仅10.4%；但EST-SSR 引物在有效引物中的多态性比 例为80%，基因组SSR 引物在有效引物中的多态性比例为100%。同时研究结果也表明，杨树SSR 标记完全 可以用于柳树群体或品种间的群传多样性分析。 关键词 杨树, SSR, 柳树, 通用性 Transferability Analysis of Populus SSR Markers in Salix Yang Yanling * Zhang Yadong Zhang Xinye Hubei Academyof Forestry, Wuhan, 430079 * Corresponding author, yangyanling999@ Abstract Simple sequence repeats (SSR) molecular markers are useful for a variety of applications in plant genetics and breeding because of their reproducibility, multiallelic nature, codominant inheritance, relative abundance and good genome coverage. In this study, the transferability of Populus SSR to salix was analyzed based on 48 pairs of genomic SSR primer and 48 pairs of EST-SSR primer from Populus, which amplified in 6 varieties of salix. The result showed that the transferability of Populus EST-SSR in Salix was 54.2%, and the transferability of genomic SSR was only 10.4%, but the percentage of polymorphism of loci of effective EST-SSR primers was 80%, and that of genomic SSR was 100%. And the result showed that Populus SSR markers can be used for population genetic analysis and diversity analysis in salix. Keywords Populus, SSR, Salix, Transferability 简单重复序列(simple sequence repeat, SSR) ，又 随着EST 计划的实施，公共数据库中的EST 数据迅 称微卫星(microsatellite) ，是一种基于DNA 长度多 猛增长。 目前EST 已逐渐发展成为寻找多态性分子 态性的分子标记技术，以 1~6 个核苷酸的串联重复 标记EST-SNP、EST-SSR 的主要数据来源，而且这些 形式，广泛分布于人类和其他动植物基因组中。SSR EST 标记已成为动植物研究的基本工具并应用各种 标记因其在动植物基因组中随机分布，呈共显性遗 遗传研究。 传，并且具有多态性高、稳定性好、多等位基因、共显 根据SSR 标记开发的方法性质不同，SSR 标记 性、数量丰富、基因组