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No.3
第29卷第3期 原 子 与 分子 物 理 学 报V01.29
OFATOMICANDMOLECULARPHYSICS
2012年6月 JOURNAL Jun.2012
doi:103969/i.issn.1000-0364.2012.03.004
3一MDM2相互作用的分子力学和动力学研究
p5
程伟渊1,梁志强2,张庆刚3,伊长虹2,王伟2,王克彦2
(1.山东交通学院外语系,济南250023;
2.山东交通学院数理幕,济南250023I
3.山东师范大学物理与电子科学学院。挤南250104)
摘要:p53-MDM2相互作用的抑制已经成为治疗癌症的新方法。拳文特分子动力学模拟和MM—PBSA
surface
(molecularmechanies/passion-Boltzmanarea)方法结合起来研究MDM2一p53相互作用机制.结果
证明范德华相互作用驱动了MDM2与p53的结舍.基于残基一残基相互作用的计算不仅证明p53的三个
7也
与MDM2有较强的相互作用.这为抗癌药物的设计提供了新靶标.同时也证明cH--CH,CH一Ⅱ和,c一
相互作用驱动了p53在MDM2疏水性裂缝中的结合.
关键词:分子动力学;MM—PBSA}结各自由能}p53一MDM2相互作用;氢键动力学
中圈分类号:Q64l-12文献标识码:A 文章编号:1000_0364(Z012)03—0393—07
into3-MDM2interactionbasedonmolecular
Insightp5 dynamics
simulationandmolecularmechanics
CHENGWei—Yuanl,LIANG
Zhi—Qian92,ZHANGQing—Gan93,YIChang—Hon矿,
WANGWei2,WANGKe-Yan2
ofForeignLanguagetShandongJiaotongUniversitytJinan25(;023.China;
(1.Department
ofMathematicsand 250023.China;
2.Department Physics,ShandoagJiaotongUniversity,Jinan
of and 250014,China)
3.CollegePhysicsElectronics,Shr山略NormalUniversity.Jinan
ofthe interactionisconsideredtobeanew toacti—
Abstract:InhibitionMDM2一p53 therapeuticstrategy
rate intumors.Molecular followedmolecularmechanics/
wild—typep53 dynamics(MD)simulationsby
sur
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