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No.3 第29卷第3期 原 子 与 分子 物 理 学 报V01.29 OFATOMICANDMOLECULARPHYSICS 2012年6月 JOURNAL Jun.2012 doi:103969/i.issn.1000-0364.2012.03.004 3一MDM2相互作用的分子力学和动力学研究 p5 程伟渊1,梁志强2,张庆刚3,伊长虹2,王伟2,王克彦2 (1.山东交通学院外语系,济南250023; 2.山东交通学院数理幕,济南250023I 3.山东师范大学物理与电子科学学院。挤南250104) 摘要:p53-MDM2相互作用的抑制已经成为治疗癌症的新方法。拳文特分子动力学模拟和MM—PBSA surface (molecularmechanies/passion-Boltzmanarea)方法结合起来研究MDM2一p53相互作用机制.结果 证明范德华相互作用驱动了MDM2与p53的结舍.基于残基一残基相互作用的计算不仅证明p53的三个 7也 与MDM2有较强的相互作用.这为抗癌药物的设计提供了新靶标.同时也证明cH--CH,CH一Ⅱ和,c一 相互作用驱动了p53在MDM2疏水性裂缝中的结合. 关键词:分子动力学;MM—PBSA}结各自由能}p53一MDM2相互作用;氢键动力学 中圈分类号:Q64l-12文献标识码:A 文章编号:1000_0364(Z012)03—0393—07 into3-MDM2interactionbasedonmolecular Insightp5 dynamics simulationandmolecularmechanics CHENGWei—Yuanl,LIANG Zhi—Qian92,ZHANGQing—Gan93,YIChang—Hon矿, WANGWei2,WANGKe-Yan2 ofForeignLanguagetShandongJiaotongUniversitytJinan25(;023.China; (1.Department ofMathematicsand 250023.China; 2.Department Physics,ShandoagJiaotongUniversity,Jinan of and 250014,China) 3.CollegePhysicsElectronics,Shr山略NormalUniversity.Jinan ofthe interactionisconsideredtobeanew toacti— Abstract:InhibitionMDM2一p53 therapeuticstrategy rate intumors.Molecular followedmolecularmechanics/ wild—typep53 dynamics(MD)simulationsby sur

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