分子生物学方法处理16SrRNA.pdfVIP

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255 ※分析检测 良晶科学 2013,V01.34,No.20 16S rRNA的分子生物学方法分析 牛奶中的细菌菌群 李引强L2,朱宝利2,吴俊2,王秋涯3,高可心4,律娜2一,张庆波1 100101; (1.河北联合大学基础医学院,河北唐山063000;2.中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室,北京 100084:4.中国人民大学附属中学,北京 3.清华大学附属中学,北京 100080) 摘要:选择4个不同生产厂家的市售牛奶作为研究对象,提取牛奶中细菌的基因组DNA,利用聚合酶链式反应 rRNA.V3区序列信息,运用生物信息学分析牛奶中细菌种类、菌 (PCR).克隆.测序的方法获得牛奶中菌群的16S 群多样性和菌群结构:荧光定量PCR法测定样品中的细菌总数。结果表明:各品牌牛奶中均含有大量细菌的16S rRNA-V3区DNA序列;牛奶样品中测序共得至11472条16SrRNA.V3区序列,其中有452条序列可以明确鉴定到属,包 括3个革兰氏阳性菌属和14个革兰氏阴性菌属;20条序列可以鉴定到纲的水平。各品牌牛奶中细菌总数均处于相对 较高水平;4个厂家牛奶间菌群分布不同,菌群多样性存在差异。 关键词:市售牛奶;16S核糖体核糖核酸(16srRNA):菌群分布;细菌总数 Molecular ofBacterial inMilkBasedon16SrRNAGene BiologicalAnalysis Community LI Jun2,WANG Na2一,ZHANG Bao.1i2,WU Ke.xin4,LU Yin.qian91…,ZHU Qiu.ya3,GAO Qing.b01 ofBasicMedical United (1.College Sciences,HebeiUniversity,Tangshan063000,China: and 100101,China; 2.KeyLaboratoryofPathogenicMicrobiologyImmunology,ChineseAcademyofSciences,Beijing 3.The SchoolAttachedto 100084,China; High TsinghuaUniversity,Beijing 4.The SchoolAtiliatedtoRenmin Hi【gh UniversityofChina,Beijing100080,China) Abstract:Thenumberofbacteriainmilkhas attentionasthenewnationalstandardis gainedgrowing dairy areconcernedabo

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