高性能计算机操作系统发展研究.pdfVIP

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2008年伞围高性能计算学术年会 高性能计算机操作系统发展研究 王星焱黄传信郑岩 (江南计算技术研究所无锡214083) 摘要:规模不断扩大的高性能计算机给其上运 行的操作系统带来了巨大的挑战。操作系统总会 1 背景 在一定程度上影响应用程序的运行,引入系统噪 声。为了减小系统噪声,提高性能,一个方向是 高性能计算机上操作系统内核的首要任务 使用轻量级操作系统,另一个是定制通用Linux是保证计算应用『F常运行的同时尽可能的不损 操作系统另外,利用系统虚拟化技术构建底层 失性能。HPC上的应用程序总希望完全占用整个 软件平台可以同时获得以上两类操作系统带来 计算节点资源,尽量少被打扰以保证高性能。高 的好处,并有更广阔的应用前景,是一个全新的 性能计算应用通常以每个CPU运行一个进程的 研究方向 形式分布在节点上,如果进程间互相依赖所得出 关键词:高性能计算机操作系统轻量级操作 的计算数拶,那么每隔一段时间,进程间就会出 系统 系统虚拟化技术 现同步动作。较快的进程必须等待较慢的进程赶 上来理想上,所有进程应该在差不多相等的时 间内完成一段计算后进人同步阶段,但是总会有 某些进程凶为某种原凶被打断一段时问,从而成 为拖慢了其他所有进程的步伐。我们称被打断的 这段时间为系统的“噪声”。如图l所示。 圄 口 口 *# %自 ## 罔1 因为同步,最慢的进程拖慢了所有进程的步伐 操作系统为了完成其管理功能,总会不断的 中断应用程序,从而产生各种系统噪声。IBM的 Ronald Mraz”最甲阐述了该问题、几乎所有的 HPC系统软件环境都面临着这样的问题。从甲期 的RedStoma、CPlant等等到ASCI Q“、Blue (;ene/L:.不同的研究人员采用不同的方法来解决 该干扰问题。比如在ASCIQ上,就是简单的去 掉许多不需要的daemon。在ASCIRed上就采取 了更为激进的方法,使用了一个非常简单的操作 高性能计算机操作系统发展研究 系统,称为Puma…这种内核就是轻量级内核。 供一段同定1:作负载,循环执行,测试每次完成 近些年来,集群在高性能计

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