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业生物技术学报 Journal of Agricultural Biotechnology 2006,14 (2): 191~ 196
·研究论文·
兔病毒性出血症病毒JX/97 株衣壳蛋白基因的序列测定与分析
光清*, 倪 征, 张玉颖, 云 涛, 梁华丽, 华炯刚, 李双茂
(浙江省农业科学院农业部病毒学与生物技术重点实验室，杭州31002 1)
摘要：对中国兔病毒性出血症病毒( , RHDV)JX/97 株的衣壳蛋白基因进行了克隆和测序。
结果表明，该蛋白的核苷酸序列长度为 1739 nt ，推导的氨基酸序列为579 aa 。利用分子生物学软件分析了该病毒与国内外22
RHDV 的基因序列，结果显示，RHDV 不同分离株之间的序列同源性几乎都在90％以上。衣壳蛋白基因的系统发生树分析
结果表明，所选的RHDV 参考毒株按照一定的遗传距离，可以分为4 个基因群，基因群之间的距离有加大的趋势，表明RHDV
受环境的影响有向不同方向演变的趋向，即RHDV 在长期适应特定环境的过程中，有可能逐渐演变成各具特色的RHDV。
： ；遗传变异
关键词 兔病毒性出血症病毒；衣壳蛋白基因
中图分类号: S184 S188 文献标识码: A 文章编号: 1006-1304(2006)02-0191-06
Analysis and Sequencing of the Capsid Protein Gene of
virus (RHDV) JX/97 Strain
LIU Guang-qing*, NI Zheng, ZHANG Yu-ying, YUN Tao,
LIANG Hua-li, HUA Jiong-gang, LI Shuang-mao
The capsid protein gene of (RHDV) JX/97 strain was cloned and sequenced .The re-
sults showed that the nucleotide sequence of the gene was 1 739 nt in length encoding a protein of 580 aa. Variation analysis of the
capsid protein gene of JX/97 strains and other 2 1 published RHDV isolates showed that RHDV had a high degree of conservation, the
homology of the amino acids among different isolates exceeded 90%. The results of computer analysis showed that the antigenic re-
gion hadn ’t changed remarkably in past 20 years. The results of phylogenetic tree analysis showed that all the reference RHDV iso-
lates could be divided into 4 genetic groups and the distant between them appeared to have evolved to di
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