DNA水平自然选择作用的检测.pdfVIP

维普资讯 动 物 学 研 究 2004，Feb．25(1)：73一舯 CN 53—-1040／Q ISSN0254—-5853 ZoologicalResearch DNA水平 自然选择作用的检测 周 琦，王 文 (中国科学院昆明动物研究所 细胞与分子进化重点实验室，中德马普青年科学家小组，云南 昆明 650223) 摘要：上个世纪6O年代，Kimura提出的 “中性进化”假说使经典的达尔文自然选择学说遭遇了前所未有 的挑战。但新近的研究表明：在DNA水平，越来越多的证据支持 “自然选择”的进化理论。这些研究成果得益 于近年来大量群体和基因组DNA数据的积累，以及理论群体遗传学的发展。在 DNA水平检测选择作用是否存 在的方法包括两大类：种内多态性检验和种间差异度检验。前者以Tajima(1989)提出的D检验为代表，后者 大都基于 “中性条件下 ，种内与种间进化速率一致”的原理。这些方法以中性假说作为零假设，结合统计检验 方法分析DNA数据，被称为 “中性检验”。这些方法对于解决一些有关进化的基础理论问题和人类遗传学及生 物信息学的深入研究都具有重要意义。本文介绍几个应用广泛的检测方法，以使国内的读者了解它们的基本思 路和操作方法。 关键词：自然选择；DNA；统计检验 中图分类号：Q31；Qlll 文献标识码 ：A 文章编号：0254—5853(2004)01—0073—08 DetectingNaturalSelectionattheDNA Level ZHOUQi．WANGW en (CAS-MaxPlanckJuniorScientistGroup，KeyLaboratoryofCellularandMolecularEvolutoin，KunmingInstituteofZoology， theChineseAcademyofSceinces，Kunming 650223，China) Abstract：Inthe1960s，theneutraltheoryproposedbyKimuracausedanunprecedentedchallengetotheclassical Darwin’stheory ofnatural selection．However，recentadvancesinevolutionary geneticshaveprovidedagreatdealofevi． denceontheroleplayedbynaturalselectionattheDNAleve1．Theseprogresseshavebeenstemmedfrom theaDpearance ofenormousDNA sequencedataofpopulationsandgenomesaswellas thedevelopmentofhteoreticalpopulationgenetics ． TherearemainlytwokindsofapproachestodetcetselectionathteDNAlevel：intraspecificpolymorphism testsandinter． specificdivergencetests．Theforme