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流平衡分析简介(Flux Balance Analysis) 马彬广 大纲 流平衡分析的含义 流平衡分析的用途 流平衡分析的流程 流平衡分析的进展 流平衡分析的工具 流平衡分析的含义 什么是流（Flux）? 流就是代谢网络中化学反应的反应速率。 在稳态下，各代谢物浓度不变，反应速率满足一定的分布（流分布）。 什么流（量）？分子类型转化流，单位时间内的转化量。 流平衡分析的含义 何谓平衡（balance）？ 平衡就是限制（约束）。 约束来自两个方面： 基本物理规律的约束，物质不灭，能量守恒等。 边界条件的约束，底物的供应量（上限），产物的生成量（下限）等。 因此，流平衡分析又称为基于约束的模型（constraint-based model）. 流平衡分析的含义 优化目标（Phenotype） 生长最快（生物量Biomass最大） 某代谢物（ATP、次级代谢物）产量最大或最小（致死） 确定优化目标下的流分布，即，线性约束下的优化问题（Linear Programming问题） 流平衡分析的用途 表型与代谢相关的问题，如： 生长速率模拟预测 次生代谢产物最大化 微生物致死的研究（抗生素研发） 动植物特定组织或发育过程中特定阶段的代谢分析等。 流平衡分析的流程 构建代谢网络； 把代谢网络表示成数学形式（计量学矩阵）； （基于稳态假设）