第三讲 代谢系统的建模-3.pptVIP

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  • 2017-07-31 发布于广东
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系统生物学 (Systems Biology) 马彬广 代谢系统建模 (第三讲) 酶促反应的动力学 代谢网络结构的化学计量学分析(Stoichiometry ) 代谢控制分析 (MCA, Metabolic Control Analysis) ∑ M ? * * 南京农业大学 生命科学学院 * * 梗概(Synopsis) 代谢控制分析理论 代谢控制分析理论是一种强大的定性定量分析工具,它主要研究代谢网络稳态特性与单个反应特性之间的关系,关注网络稳态性质,对于小的参数变化的敏感性。 代谢控制分析理论主要解决如下问题: 整个代谢网络的行为能否根据单个反应的特性进行预测? 哪些单步的反应控制着稳态的流分布和代谢物浓度?是否存在限速步骤? 哪个酶的效应物或者修饰对于代谢网络的影响最显著? 控制分析系数 代谢网络的行为由其组分性质(单个反应及其动力学特征)和网络结构(不同反应所包含的反应物,或简言之,化学计量学)所共同决定,因此,对网络中的一个反应所施加的影响将由该反应的局部特征和该反应在网络全局中的地位所共同决定。 令γ(x)表示某变量随另一个变量x的变化。改变量Δx对γ所产生的影响由如下系数表示: 该系数表示相对量之比,前面的因子x /γ是归一化因子,使系数独立于单位和数量级。 在Δx→0时,根据极限的定义,有: 数学上,等价于: 归一化带来问题:当γ等于

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