第三讲 代谢系统的建模-2(1).pptVIP

系统生物学(Systems Biology) 马彬广 代谢系统建模 （第三讲） 酶促反应的动力学 代谢网络结构的化学计量学分析(Stoichiometry ) 代谢控制分析 (MCA, Metabolic Control Analysis) ∑ M ? * * 南京农业大学 生命科学学院 * * * 梗概（Synopsis） Transport Polymerization and assembly Core metabolism Autocatalytic and regulatory feedback Whole cell metabolism 代谢网络结构的化学计量学分析 本节将讲解代谢网络的基本结构和动力学特性。这里将引入对网络的化学计量学描述，并学习各成份和流如何在网络中平衡。 代谢网络模型的基本元件有(1) 物质及其浓度；（2）改变物质浓度的反应或转运过程。 在生物环境中，反应通常由酶来催化，而转运步骤则由转运蛋白或相关通道来执行。它们可以用相同的模型进行描述。 化学计量系数表示反应中底物和产物分子的份数，例如对于如下反应： S1、S2和P的化学计量学系数分别是-1、-1和2，即，1摩尔S1和1摩尔的S2反应，生产2摩尔的产物P；化学计量学系数的赋值不唯一，我们也可以说，每生成一摩尔的P，