一种大豆SNP分型新方法.pdfVIP

V01．26 第26卷第4期 大豆科学 No．4 2007拒 8月 SOYBEANSCIENCE Aug．8007 一种大豆SNP分型新方法 袁翠平，李英慧，刘章雄，关荣霞，常汝镇，邱丽娟 (中国农业科学院作物科学研究所／国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程／农业部作物种质资源与 生物技术重点开放实验室，北京100081) 析、分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文以Rh94基因开发的5个SNP为例，介绍了一种 入错配碱基皋提高PCR特异性，通过6％变性聚丙烯酰胺凝胶电泳可将纯合和杂合基因型检测出 来。探讨了特异引物浓度和退火温度对Rh酣一1592扩增效果的影响，研究表明，可通过调整特异 法一致，表明本研究建立的FLDAS--PCR法是一种简便、快捷、新型的大豆SNP分型方法。 关键词 大豆ISNP；分型；片段长度差异等位基目特异性PCR 中图分类号$565．1 AMETHODSNPGENOTYPINGINSOYBEAN OF YUAN Zhang—xiong，GUAN Ru-zhen，QIULi-juan Cui：-ping，LIYing—hui，LIU Rong-xia，CHANG (Chinese Sciences，InstituteSciences／National AcademyofAgricultural ofCrop KeyFacilityforCrop GeneResourcesandGenetic Improvement，KeyLaboratoryofCrop 100081) Beijing Abstract nucleotide a mutationfor Single polymorphism(SNP)isgenome——wide type organ— isms．SNP isan forSNP genotypingimportanttechnique geneticmapping，associationanalysis， assistantselectionand andmolecular soon．Weintroduceda allele fragmentlengthdiscrepantspe— cific for 5 SNPsin ex— PCR(FLDAS--PCR)methodSNP in as genotypingsoybean，usingRh94 a SNP10ci，we 2allele whichhad difference amples．For designed specificprimers 4—5bp1ength and3J—end toeachofbi—allelicSNPs．and1common aresultPCR complementary primer．as ofdifferentalleleshad differencein couldbe 6％de— products