广西16株狂犬病毒P基因序列分析.pdfVIP

广西 2．3P蛋白主要功能位点比较与宁夏株和CTN疫 CGX0603DEU004755 SADBl9M31046 美国 贵港市 苗株的P蛋白序列比较，16株狂犬病毒P基因序列推到 贵州 bat European CGZ0619D EU004763 AF049121 的氨基酸序列多个位点发生变异，与L蛋白的主要作 黔南州 lyssavirus 广西 Duvenhage CGX0614DEU004758 AF049120 来宾di Vlll腮 广西 CGX0625DEU00476l MokolavirusAF049118 来宾市 位氨基酸为两个明显的高变区，所测标本在该区域氨 湖南 bat CHN0642DEU004778 Lagos AF049119 基酸变异较大，22l位氨基酸以后的羧基端也出现多 湘西州 VllrUS 个位点氨基酸的改变；第143．148位氨基酸是与LC8作 二、结果 氨基酸是P蛋白与N蛋白相互作用的主要功能区，均为 2．1P基因核苷酸序列及推导氨基酸序列同源性分 FSKKYKFP。 析16株广西狂犬病毒P基因开放读码框(ORF)长均 为894个核苷酸残基，编码297个氨基酸，各毒株P基 三、讨论 因间的核苷酸及氨基酸同源性分别为86％～100％和 狂犬病是人类病死率最高的传染病之一，病死率 93％～100％，其中GX0806、GX0801、GX0805的核苷 几乎达100％，广西近几年狂犬病持续高发】，是我国 酸和氨基酸同源性达100％。与疫苗株P基因同源性比 狂犬病流行的高发省份之一，研究广西健康犬只中狂 较，GX0809、GX0806、GX0801、GX0805与CTN株具 犬病毒基因特点对人间狂犬病预防和控制具有重要的 有较高的同源性，核苷酸和氨基酸同源性均为99％， 意义。 GX0803、GX0804与CTN株的同源性较低，核苷酸和 广西16株狂犬病毒均来自调查地区的居民饲养并 氨基酸同源性分别为89％和92％。 出售的健康犬只，16株病毒P基因的核苷酸和氨基酸同 2．2P基因片段核苷酸序列种系发生分析广西16 源性分别为86％～loo％和93％～100％，部分毒株之间 株狂犬病与从GenbankiJI用的狂犬病毒代表株以NJ法构 建P基因核苷酸序列进化发生树(图1)。在P基因核苷自河池、柳州和白色，他们之间的核苷酸和氨基酸同 酸序列进化发生树中，广西16株狂犬病毒独立于其他6 源性达lOO％，表明广西境内存在多个狂犬病毒株系的 个基因型，与国内外狂犬基因I型代表株聚集在一个 流行，且同一毒株系在不同地区间相互传播。 大分支下，属于基因I型。16株毒株又分为3个亚群， 在P基因核苷酸序列构建