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动物分子生物学实验.doc
实验一 分子生物学仪器的使用及原理
实验目的
1.学习认识分子生物学实验室的仪器设备
2.了解分子生物学仪器设备使用的注意事项
二、主要仪器设备
普通离心机
无菌操作台
高速冷冻离心机
PCR仪
恒温振荡摇床
真空干燥箱
恒温水浴锅
紫外分光光度计
微波炉
微量移液器
Eppendorf管
高压灭菌锅
电泳仪
凝胶成像系统
紫外仪
三、实验报告要求
写出分子生物学主要仪器设备的使用注意事项
实验二:质粒(pEGFP-N1)的提取与酶切
一. 实验目的了解碱裂解法提取质粒的基本原理和主要应用,掌握碱裂解法提取质粒的实验方法和各种试剂在提取过程中的作用。二. 实验原理碱裂解法是利用细菌染色体DNA与质粒DNA结构的大小差异来分离质粒DNA的。碱性(pH 12.012.5)条件可以破坏碱基配对,宿主和质粒DNA的碱基之间的氢键被破坏。当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),共价闭合环状的质粒DNA会迅速准确地恢复配对,重新形成完全天然的超螺旋分子;而较大的细菌染色体DNA分子则难以复性,会交联形成不溶于水的线团结构,缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来,而质粒DNA则留在上清液中,用异丙醇沉淀、70 %乙醇洗涤即可获得质粒DNA。三. 仪器设备 微量取液器(2 μL;20 μL;200 μL;1 000 μL),tip头,手掌型离心机,1.5 mL离心管, 恒温水浴,制冰机,超净工作台,恒温培养箱。振荡器,离心机,金属浴,电泳仪,凝胶成像仪。 四.实验试剂1.溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖;20 mmol/L Tris·HCl(pH = 8.0);10 mmol/L EDTA(pH=8.0),高压蒸汽灭菌(121 ℃,0.105 Mpa)20 min。4 ℃贮存。2.溶液Ⅱ(现用现配):0.2 mol/L NaOH;1 g / L SDS。3.溶液Ⅲ(pH 4.8):每100 mL溶液中含5 mol/L乙酸钾60 mL;冰乙酸11.5 mL;H2O 28.5 mL。4.RNase(10 mg / mL),LB液体培养基,氨苄青霉素,异丙醇,70 %(V / V)乙醇,无菌水。五.实验步骤:1) 挑取LB固体培养基上生长的单菌落,接种于3-5mlLB(含氨苄)液体培养基中,37℃振荡培养12-14小时。取上述培养物移入1.5mlep管中,室温以8000r/min离心5分钟,弃上清,再加1.5ml上述养物于ep管中,室温以8000r/min再离心5分钟。弃上清液,将离心管倒置,使液体尽可能流尽。加溶液Ⅰ100μl,用力弹ep管,使菌体分散均匀;加溶液Ⅱ200μl,颠倒数次混匀(不要剧烈振荡),并将离心ep管放置于冰上5分钟,使细胞膜裂解(溶液Ⅱ为裂解液,故离心管中菌液逐渐变清)。加入150μl预冷的溶液Ⅲ,将管温和颠倒数次混匀,见白色絮状沉淀,可在冰上放置10分钟。(溶液Ⅲ为中和溶液,此时质粒DNA复性,染色体和蛋白质不可逆变性,形成不可溶复合物,同时K+使SDS-蛋白复合物沉淀。)然后,室温以12000r/min离心5分钟。抽取上清液于一新微量离心管(ep管)中,加无水乙醇900μl,冰浴20分钟,室温以13000r/min离心10分钟,放入净化工作台用风机吹干,加TE,定容至30μl,再加RNA酶5μl,37℃水浴30分钟。(-20℃保存备用)1) 制胶:1%琼脂糖电泳:琼脂糖0.5克,TBE50毫升放电炉上使之融化,温度降到50摄氏度时加入EB冷凝后倒胶,30分钟后凝固,拔去梳子。2) 加样:取已转化的感受态细胞溶液10微升,再加5微升上样液。3) 电泳:电压40V和电流50mA 条件下,50分钟后用紫外灯观察(有无条带),若有条带跑出,进行抽提。加TE400微升、酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)400微升,用力弹匀。室温下,12500rpm离心10分钟。观察到液体分三层,取上层液于一新灭菌过的EP管中,再加氯仿400微升,然后室温下,12500rpm离心10分钟。取上清液,加无水乙醇900—1000微升、乙酸铵100微升,用力震荡。-20摄氏度下放置1-1.5小时,然后室温下,13000rpm离心5-10分钟。弃去上清液,加75%的酒精混匀。室温下,12500rpm离心5分钟。弃去上清,把EP管放入净化工作台用风机吹干后,用TE定容至30微升。4) 酶切:30微升体系取上述液体15微升,加多组分缓冲液3微升BSA 3微升 灭菌超纯水7微升HINDIII和BamHI 各1微升 以上操作皆在冰上,操作完后37摄氏度水浴3—4小时。
实验三:PCR基因扩增
一、实验目的:通过本实验学习PCR反应的基本原理和试验技术。二、实验原理:多聚酶链式反应的原理类似于DNA的天然复制过程。
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